Gene expression profiling of the brain: pondering facts and fiction.
Gene expression profiling of the brain: pondering facts and fiction.
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DOI：
10.1016/j.nbd.2011.06.001
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发表时间：
2012-01
影响因子：
6.1
通讯作者：
Mirnics, Karoly
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mitchell, Amanda C.;Mirnics, Karoly
关键词：
在过去的十年中，通过DNA微阵列进行脑转录组谱分析已经成熟，发展了完善的实验设计标准、报告实践、分析程序和数据共享资源。它已经成为探索性研究组合中的一个强大的科学工具。在这个反复试错的过程中，我们遇到了一些有趣的问题和评论--思考假设驱动的研究的价值、适当的样本量、转录变化相对于蛋白质变化的重要性和解释、统计严格性的作用、错误发现和表达变化的大小，以及许多其他有趣的问题。我们的领域充分认识到并努力解决与高通量、数据驱动的转录组相关的所有这些挑战。作为一个研究领域，我们强烈主张实施我们行业的最高标准，我们坚信转录组图谱研究将继续是破译导致复杂大脑疾病的病理生理机制的关键。
During the last decade brain transcriptome profiling by DNA microarrays has matured, developed sound experimental design standards, reporting practices, analytical procedures, and data sharing resources. It has become a powerful scientific tool in the exploratory research portfolio. Along this journey by trial and error, we encountered a number of intriguing questions and comments - pondering the value of hypothesis-driven research, appropriate sample size, the importance and interpretation of transcripts changes vis-à-vis protein changes, the role of statistical stringency, false discovery and magnitude of expression change, and many other interesting questions. Our field fully acknowledges and tries to address all of these challenges associated with high-throughput, data-driven transcriptomics. As a research field, we strongly advocate implementing the highest standards of our trade, and we deeply believe that transcriptome profiling studies will continue to be essential for deciphering the pathophysiological mechanisms leading to complex brain disorders.
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影响因子：
6.1
作者：
Hollingshead, D;Lewis, DA;Mirnics, K
通讯作者：
Mirnics, K
WGCNA：用于加权相关网络分析的 R 包。
影响因子：
3
作者：
Langfelder P;Horvath S
通讯作者：
Horvath S
影响因子：
12.3
作者：
Gentleman RC;Carey VJ;Bates DM;Bolstad B;Dettling M;Dudoit S;Ellis B;Gautier L;Ge Y;Gentry J;Hornik K;Hothorn T;Huber W;Iacus S;Irizarry R;Leisch F;Li C;Maechler M;Rossini AJ;Sawitzki G;Smith C;Smyth G;Tierney L;Yang JY;Zhang J
通讯作者：
Zhang J
DOI：
10.1073/pnas.93.10.4760
发表时间：
1996-05-14
影响因子：
11.1
作者：
McMahon, HT;Bolshakov, VY;Sudhof, TC
通讯作者：
Sudhof, TC
DOI：
10.1073/pnas.032069099
发表时间：
2002-04-02
影响因子：
11.1
作者：
Mimmack, ML;Ryan, M;Bahn, S
通讯作者：
Bahn, S