DynamicRoots: A Software Platform for the Reconstruction and Analysis of Growing Plant Roots.
DynamicRoots: A Software Platform for the Reconstruction and Analysis of Growing Plant Roots.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0127657
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发表时间：
2015
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Edelsbrunner H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Symonova O;Topp CN;Edelsbrunner H
我们提出了一个软件平台，用于重建和分析植物根系的生长从一个时间序列的三维体素化形状。它将形状彼此对齐，构造几何图形表示以及记录生长时间的函数，并将分支组织成反映创建顺序的层次结构。该软件包括系统中每个根的结构和动态特性的自动计算，从而能够在精细尺度上量化生长。这些都是植物表型研究的重要进展，可应用于研究遗传和环境对生长的影响。
We present a software platform for reconstructing and analyzing the growth of a plant root system from a time-series of 3D voxelized shapes. It aligns the shapes with each other, constructs a geometric graph representation together with the function that records the time of growth, and organizes the branches into a hierarchy that reflects the order of creation. The software includes the automatic computation of structural and dynamic traits for each root in the system enabling the quantification of growth on fine-scale. These are important advances in plant phenotyping with applications to the study of genetic and environmental influences on growth.
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影响因子：
7.2
作者：
Jahnke, Siegfried;Menzel, Marion I.;Schurr, Ulrich
通讯作者：
Schurr, Ulrich
影响因子：
9.7
作者：
Perret, J. S.;Al-Belushi, M. E.;Deadman, M.
通讯作者：
Deadman, M.
DOI：
10.1109/34.121791
发表时间：
1992-02-01
影响因子：
23.6
作者：
BESL, PJ;MCKAY, ND
通讯作者：
MCKAY, ND
影响因子：
7.2
作者：
Fang, Suqin;Yan, Xiaolong;Liao, Hong
通讯作者：
Liao, Hong
影响因子：
3.3
作者：
Miller, Nathan D.;Brooks, Tessa L. Durham;Spalding, Edgar P.
通讯作者：
Spalding, Edgar P.