RNA sequencing: advances, challenges and opportunities.
RNA sequencing: advances, challenges and opportunities.
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DOI：
10.1038/nrg2934
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发表时间：
2011-02
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
在其最初应用后的短短几年内，大规模平行cDNA测序（即RNA - seq）在转录组的表征和定量方面取得了许多进展。最近，RNA - seq方法的一些发展为RNA转录本提供了更完整的表征。这些发展包括转录起始位点定位的改进、链特异性测量、基因融合检测、小RNA表征以及可变剪接事件的检测。正在进行的发展有望使RNA - seq的应用取得进一步进展，特别是直接RNA测序以及能够对极少量细胞物质中的RNA进行定量的方法。
In the few years since its initial application, massively parallel cDNA sequencing, or RNA-seq, has allowed many advances in the characterization and quantification of transcriptomes. Recently, several developments in RNA-seq methods have provided an even more complete characterization of RNA transcripts. These developments include improvements in transcription start site mapping, strand-specific measurements, gene fusion detection, small RNA characterization and detection of alternative splicing events. Ongoing developments promise further advances in the application of RNA-seq, particularly direct RNA sequencing and approaches that allow RNA quantification from very small amounts of cellular materials.
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影响因子：
12.3
作者：
Cirulli ET;Singh A;Shianna KV;Ge D;Smith JP;Maia JM;Heinzen EL;Goedert JJ;Goldstein DB;Center for HIV/AIDS Vaccine Immunology (CHAVI)
通讯作者：
Center for HIV/AIDS Vaccine Immunology (CHAVI)
DOI：
10.1126/science.1179050
发表时间：
2009-10-09
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Amit I;Garber M;Chevrier N;Leite AP;Donner Y;Eisenhaure T;Guttman M;Grenier JK;Li W;Zuk O;Schubert LA;Birditt B;Shay T;Goren A;Zhang X;Smith Z;Deering R;McDonald RC;Cabili M;Bernstein BE;Rinn JL;Meissner A;Root DE;Hacohen N;Regev A
通讯作者：
Regev A
影响因子：
48
作者：
Cloonan, Nicole;Forrest, Alistair R. R.;Grimmond, Sean M.
通讯作者：
Grimmond, Sean M.
影响因子：
48
作者：
Goren, Alon;Ozsolak, Fatih;Shoresh, Noam;Ku, Manching;Adli, Mazhar;Hart, Chris;Gymrek, Melissa;Zuk, Or;Regev, Aviv;Milos, Patrice M.;Bernstein, Bradley E.
通讯作者：
Bernstein, Bradley E.
影响因子：
7
作者：
Berger, Michael F.;Levin, Joshua Z.;Garraway, Levi A.
通讯作者：
Garraway, Levi A.