RNAi screening reveals a large signaling network controlling the Golgi apparatus in human cells.
RNAi screening reveals a large signaling network controlling the Golgi apparatus in human cells.
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DOI：
10.1038/msb.2012.59
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发表时间：
2012
影响因子：
9.9
通讯作者：
Bard, Frederic
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chia, Joanne;Goh, Germaine;Racine, Victor;Ng, Susanne;Kumar, Pankaj;Bard, Frederic
高尔基体具有许多重要的生理功能，包括分泌物的分类和复杂聚糖的生物合成。这些功能依赖于高尔基体的复杂和划分的组织。为了研究调节高尔基体结构的机制，我们开发了一种使用三种不同高尔基体隔室标记和定量图像分析的定量形态学分析，并在HeLa细胞中进行了kinome和phosphatome范围的RNAi筛选。159个信号基因的缺失，近20%的基因被检测，引起高尔基形态的强烈和不同的扰动。利用生物信息学数据，可以构建一个大型的监管网络。特定的子网络参与磷酸肌苷调节、肌动蛋白动力学和有丝分裂原激活的蛋白激酶信号传导。大多数基因缺失也影响高尔基功能，特别是聚糖生物合成，这表明信号级联可以直接在高尔基水平上控制糖基化。我们的研究结果提供了控制人类细胞中高尔基体的信号通路的遗传概述。
The Golgi apparatus has many important physiological functions, including sorting of secretory cargo and biosynthesis of complex glycans. These functions depend on the intricate and compartmentalized organization of the Golgi apparatus. To investigate the mechanisms that regulate Golgi architecture, we developed a quantitative morphological assay using three different Golgi compartment markers and quantitative image analysis, and performed a kinome- and phosphatome-wide RNAi screen in HeLa cells. Depletion of 159 signaling genes, nearly 20% of genes assayed, induced strong and varied perturbations in Golgi morphology. Using bioinformatics data, a large regulatory network could be constructed. Specific subnetworks are involved in phosphoinositides regulation, acto-myosin dynamics and mitogen activated protein kinase signaling. Most gene depletion also affected Golgi functions, in particular glycan biosynthesis, suggesting that signaling cascades can control glycosylation directly at the Golgi level. Our results provide a genetic overview of the signaling pathways that control the Golgi apparatus in human cells.
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二聚体 PKD 调节膜裂变以在 TGN 处形成运输载体。
影响因子：
7.8
作者：
Bossard, Carine;Bresson, Damien;Polishchuk, Roman S.;Malhotra, Vivek
通讯作者：
Malhotra, Vivek
影响因子：
7.5
作者：
Boscher, Cecile;Dennis, James W.;Nabi, Ivan R.
通讯作者：
Nabi, Ivan R.
影响因子：
64.8
作者：
Bard, F;Casano, L;Malhotra, V
通讯作者：
Malhotra, V
DOI：
10.1073/pnas.78.12.7453
发表时间：
1981-01-01
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA-BIOLOGICAL SCIENCES
影响因子：
--
作者：
DUNPHY, WG;FRIES, E;ROTHMAN, JE
通讯作者：
ROTHMAN, JE
影响因子：
10.8
作者：
Blayney, L;Gapper, P;Rix, C
通讯作者：
Rix, C