The complete plastome genome of Incarvillea compacta (Bignoniaceae), an alpine herb endemic to China.
The complete plastome genome of Incarvillea compacta (Bignoniaceae), an alpine herb endemic to China.
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中国特有高山草本植物紫葳科的完整质体基因组
DOI：
10.1080/23802359.2019.1681916
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发表时间：
2019-10-25
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Chen S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wu X;Peng C;Li Z;Chen S
摘要 密瓣花是横断山特有的濒危物种，其生存面积不断减少。在本研究中，我们组装并表征了该物种的完整叶绿体（cp）基因组。质体基因组长度为150,154bp，总GC含量约为40.5%。该环状分子包含110个基因，其中包括77个蛋白质编码基因、29个tRNA和4个rRNA。系统发育分析表明，I. Compacta 是 Tecomaria capensis 的姐妹。
Abstract Incarvillea compacta is a threatened species endemic to the Hengduan Mountain and has been undergoing a successive reduction in the area of occupancy. In the present study, we assembled and characterised the complete chloroplast (cp) genomes of this species. The plastome genome was 150,154 bp in length, and overall GC content was about 40.5%. The circle molecular contained 110 genes including 77 protein-coding genes, 29 tRNA, and four rRNA. Phylogenetic analysis suggested that I. compacta is sister to Tecomaria capensis.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/bts199
发表时间：
2012-06-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
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通讯作者：
NEI, M
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作者：
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