From simple to complex: Reconstructing all-atom structures from coarse-grained models using cg2all.

From simple to complex: Reconstructing all-atom structures from coarse-grained models using cg2all.
复制标题

从简单到复杂:使用 cg2all 从粗粒度模型重建全原子结构。

DOI:
10.1016/j.str.2023.12.004
复制
发表时间:
2024
期刊:
Structure (London, England : 1993)
影响因子:
--
通讯作者:
Gumbart,JamesC
Gumbart,JamesC
中科院分区:
--
文献类型:
--
作者:
Pang,YuiTik;Yang,Lixinhao;Gumbart,JamesC

文献摘要

参考文献

相似文献

在本期《Structure》中,Heo 和 Feig 提出了 cg2all,这是一种新型深度学习模型,能够根据粗粒度 (CG) 表示有效预测全原子蛋白质结构。即使 CG 模型被简化为每个残基一个珠子,该模型仍能保持高精度,并且具有许多有前景的应用。
In this issue ofStructure, Heo and Feig present cg2all, a novel deep-learning model capable of efficiently predicting all-atom protein structures from coarse-grained (CG) representations. The model maintains high accuracy, even when the CG model is simplified to a single bead per residue, and has a number of promising applications.
DOI: 10.1038/s41586-021-03819-2
发表时间: 2021-08
期刊: Nature
影响因子: 64.8
作者:
Jumper J;Evans R;Pritzel A;Green T;Figurnov M;Ronneberger O;Tunyasuvunakool K;Bates R;Žídek A;Potapenko A;Bridgland A;Meyer C;Kohl SAA;Ballard AJ;Cowie A;Romera-Paredes B;Nikolov S;Jain R;Adler J;Back T;Petersen S;Reiman D;Clancy E;Zielinski M;Steinegger M;Pacholska M;Berghammer T;Bodenstein S;Silver D;Vinyals O;Senior AW;Kavukcuoglu K;Kohli P;Hassabis D
通讯作者: Hassabis D
分子动力学柔性拟合方法的应用。
DOI: 10.1016/j.jsb.2010.09.024
发表时间: 2011-03
影响因子: 3
作者:
Trabuco, Leonardo G.;Schreiner, Eduard;Gumbart, James;Hsin, Jen;Villa, Elizabeth;Schulten, Klaus
通讯作者: Schulten, Klaus
DOI: 10.1016/j.str.2023.10.013
发表时间: 2023-11
期刊: Structure
影响因子: 5.7
作者:
Lim Heo;M. Feig
通讯作者: Lim Heo;M. Feig
DOI: 10.1038/s41592-021-01098-3
发表时间: 2021-03-29
期刊: NATURE METHODS
影响因子: 48
作者:
Souza, Paulo C. T.;Alessandri, Riccardo;Marrink, Siewert J.
通讯作者: Marrink, Siewert J.