Enhancing epidemiological surveillance of the emergence of the SARS-CoV-2 Omicron variant using spike gene target failure data, England, 15 November to 31 December 2021.
Enhancing epidemiological surveillance of the emergence of the SARS-CoV-2 Omicron variant using spike gene target failure data, England, 15 November to 31 December 2021.
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使用Spike基因靶功能数据数据，英格兰11月15日至2021年12月31日，增强了SARS-COV-2 OMICRON变体出现的流行病学监测。
DOI：
10.2807/1560-7917.es.2022.27.11.2200143
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发表时间：
2022-03
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Lake IR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Blomquist PB;Bridgen J;Bray N;O'Connell AM;West D;Groves N;Gallagher E;Utsi L;Jarvis CI;Hardstaff JL;Byers C;Metelmann S;Simons D;Zaidi A;Twohig KA;Savagar B;Løchen A;Ryan C;Wrenn K;Saavedra-Campos M;Abedin Z;Florence I;Cleary P;Elson R;Vivancos R;Lake IR
当 2021 年 SARS-CoV-2 Omicron 出现时，S 基因靶点失败使得 Omicron 和主要的 Delta 变种得以区分。在英国，S 基因靶点监测 (SGTS) 已经建立，这使得能够快速识别（在样本采集后约 3 天内）可能的 Omicron 病例，同时实时监测和模拟 Omicron 生长。 SGTS 是公共卫生行动（包括病例识别和事件管理）的关键，我们分享有关如何以及何时使用 SGTS 的应用见解。
When SARS-CoV-2 Omicron emerged in 2021, S gene target failure enabled differentiation between Omicron and the dominant Delta variant. In England, where S gene target surveillance (SGTS) was already established, this led to rapid identification (within ca 3 days of sample collection) of possible Omicron cases, alongside real-time surveillance and modelling of Omicron growth. SGTS was key to public health action (including case identification and incident management), and we share applied insights on how and when to use SGTS.
DOI：
10.3390/pathogens11020124
发表时间：
2022-01-20
期刊：
Pathogens (Basel, Switzerland)
影响因子：
--
作者：
Giraudon H;Djemai M;Auvray C;de Rougemont A;Belliot G;Bour JB;Manoha C
通讯作者：
Manoha C