ALTER: program-oriented conversion of DNA and protein alignments.
ALTER: program-oriented conversion of DNA and protein alignments.
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DOI：
10.1093/nar/gkq321
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发表时间：
2010-07
影响因子：
14.9
通讯作者：
Posada D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Glez-Peña D;Gómez-Blanco D;Reboiro-Jato M;Fdez-Riverola F;Posada D
ALTER是一个开放的基于web的工具，用于在不同的多个序列对齐格式之间进行转换。ALTER的独创性在于，它关注的是主流校准和分析程序的规范，而不是或多或少特定格式之间的转换。此外，ALTER能够在转换过程中识别和删除相同的序列。除了用户友好的环境之外，ALTER还允许通过具象状态转移web服务以编程的方式访问其功能。ALTER的前端和API分别可以在http://sing.ei.uvigo.es/ALTER/和http://sing.ei.uvigo.es/ALTER/api/上免费获得。
ALTER is an open web-based tool to transform between different multiple sequence alignment formats. The originality of ALTER lies in the fact that it focuses on the specifications of mainstream alignment and analysis programs rather than on the conversion among more or less specific formats. In addition, ALTER is capable of identify and remove identical sequences during the transformation process. Besides its user-friendly environment, ALTER allows access to its functionalities in a programmatic way through a Representational State Transfer web service. ALTER’s front-end and its API are freely available at http://sing.ei.uvigo.es/ALTER/ and http://sing.ei.uvigo.es/ALTER/api/, respectively.
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影响因子：
10.7
作者：
Castresana, J
通讯作者：
Castresana, J
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btp163
发表时间：
2009-06-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Cock PJ;Antao T;Chang JT;Chapman BA;Cox CJ;Dalke A;Friedberg I;Hamelryck T;Kauff F;Wilczynski B;de Hoon MJ
通讯作者：
de Hoon MJ
影响因子：
4.9
作者：
Clement, M;Posada, D;Crandall, KA
通讯作者：
Crandall, KA
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp348
发表时间：
2009-08-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Capella-Gutiérrez S;Silla-Martínez JM;Gabaldón T
通讯作者：
Gabaldón T
影响因子：
5.8
作者：
Larkin, M. A.;Blackshields, G.;Higgins, D. G.
通讯作者：
Higgins, D. G.