Escherichia coli DNA ligase B may mitigate damage from oxidative stress.
Escherichia coli DNA ligase B may mitigate damage from oxidative stress.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0180800
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发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Zechiedrich L
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bodine TJ;Evangelista MA;Chang HT;Ayoub CA;Samuel BS;Sucgang R;Zechiedrich L
大肠杆菌编码两种 DNA 连接酶：连接酶 A（在正常实验室生长条件下是必需的）和连接酶 B（不是）。在这里，我们报告了连接酶 B 的潜在功能。我们发现，在整个肠杆菌科家族中，连接酶 B 在氨基酸同一性和与氧化应激相关基因的同线性方面都高度保守。 ligB 的缺失使大肠杆菌对特定的 DNA 损伤剂和抗生素敏感，导致突变表型较弱，生物膜形成减少。 ligB 的过度表达导致滞后期急剧延长，最终恢复正常生长。连接酶 B 的连接酶功能不需要介导延长的滞后期，因为连接酶缺陷的 ligB 突变体的过度表达也会阻碍生长。对数生长过程中ligB的过度表达导致细胞生长和DNA复制立即受阻，并导致约一半细胞死亡。这些数据支持连接酶 B 在碱基切除修复途径或错配修复途径中的潜在作用。
Escherichia coli encodes two DNA ligases, ligase A, which is essential under normal laboratory growth conditions, and ligase B, which is not. Here we report potential functions of ligase B. We found that across the entire Enterobacteriaceae family, ligase B is highly conserved in both amino acid identity and synteny with genes associated with oxidative stress. Deletion of ligB sensitized E. coli to specific DNA damaging agents and antibiotics resulted in a weak mutator phenotype, and decreased biofilm formation. Overexpression of ligB caused a dramatic extension of lag phase that eventually resumed normal growth. The ligase function of ligase B was not required to mediate the extended lag phase, as overexpression of a ligase-deficient ligB mutant also blocked growth. Overexpression of ligB during logarithmic growth caused an immediate block of cell growth and DNA replication, and death of about half of cells. These data support a potential role for ligase B in the base excision repair pathway or the mismatch repair pathway.
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DOI：
10.1073/pnas.1210309109
发表时间：
2012-10-09
影响因子：
11.1
作者：
Lee, Heewook;Popodi, Ellen;Foster, Patricia L.
通讯作者：
Foster, Patricia L.
影响因子：
4.9
作者：
Boyd, Lauren Becnel;Maynard, Merry J.;Zechiedrich, Lynn
通讯作者：
Zechiedrich, Lynn
影响因子：
64.5
作者：
Kohanski, Michael A.;Dwyer, Daniel J.;Collins, James J.
通讯作者：
Collins, James J.
影响因子：
3.8
作者：
Ito, Akinobu;May, Thithiwat;Okabe, Satoshi
通讯作者：
Okabe, Satoshi
大肠杆菌K-12的构造框架，单基因敲除突变体：Keio Collection。
影响因子：
9.9
作者：
通讯作者：
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