High-throughput middle-down analysis using an orbitrap.
High-throughput middle-down analysis using an orbitrap.
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DOI：
10.1021/pr1000994
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发表时间：
2010-08-06
影响因子：
4.4
通讯作者：
Fenselau C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cannon J;Lohnes K;Wynne C;Wang Y;Edwards N;Fenselau C
这份报告展示了毛细管LC-LTQ-Orbitrap系统的应用，以提供对质量范围在3000到10000 Da之间的蛋白水解肽的自动中下分析。这一新的工作流程结合了Orbitrap中未得到充分利用的方法(高分辨率、质量准确的产品离子测量)、为搜索此类数据量身定做的软件(ProSightPC 2.0)以及可在更大质量范围内生成多肽的Asp选择性化学裂解方法。对前体离子和产物离子进行高分辨率质量测量的策略类似于FT-ICR分析仪上广泛使用的策略。这种方法在对从人MCF7癌细胞中分离的高度碱性核糖体蛋白质组的分析中得到了证明。
This report demonstrates the application of a capillary LC-LTQ-orbitrap system to provide automated middle-down analysis of proteolytic peptides in the mass range 3000 to 10,000 Da. The novel workflow combines an underutilized method in the orbitrap—high resolution, mass-accurate product ion measurements—with software tailored to search such data (ProSightPC 2.0) and an Asp-selective chemical cleavage approach that generates peptides across an extended mass range. The strategy using high resolution mass measurements on both precursor and product ions is analogous to that widely used on FT-ICR analyzers. The approach is demonstrated in an analysis of the highly basic ribosomal proteome isolated from human MCF7 cancer cells.
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影响因子：
1.8
作者：
Li, Jinxi;Shefcheck, Kevin;Fenselau, Catherine
通讯作者：
Fenselau, Catherine
影响因子：
7.4
作者：
Wynne, Colin;Fenselau, Catherine;Edwards, Nathan
通讯作者：
Edwards, Nathan
DOI：
10.1016/j.jasms.2009.08.001
发表时间：
2009-12
影响因子：
3.2
作者：
Lee JE;Kellie JF;Tran JC;Tipton JD;Catherman AD;Thomas HM;Ahlf DR;Durbin KR;Vellaichamy A;Ntai I;Marshall AG;Kelleher NL
通讯作者：
Kelleher NL
影响因子：
4.4
作者：
Wu, Shiaw-Lin;Huehmer, Andreas F. R.;Karger, Barry L.
通讯作者：
Karger, Barry L.
影响因子：
7.4
作者：
Swatkoski, S;Russell, SC;Fenselau, C
通讯作者：
Fenselau, C