Identification of a CpG island methylator phenotype that defines a distinct subgroup of glioma.
Identification of a CpG island methylator phenotype that defines a distinct subgroup of glioma.
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DOI：
10.1016/j.ccr.2010.03.017
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发表时间：
2010-05-18
期刊：
影响因子：
50.3
通讯作者：
Cancer Genome Atlas Research Network
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Noushmehr H;Weisenberger DJ;Diefes K;Phillips HS;Pujara K;Berman BP;Pan F;Pelloski CE;Sulman EP;Bhat KP;Verhaak RG;Hoadley KA;Hayes DN;Perou CM;Schmidt HK;Ding L;Wilson RK;Van Den Berg D;Shen H;Bengtsson H;Neuvial P;Cope LM;Buckley J;Herman JG;Baylin SB;Laird PW;Aldape K;Cancer Genome Atlas Research Network
我们在癌症基因组图谱（TCGA）的背景下分析了272例胶质母细胞瘤肿瘤的启动子DNA甲基化改变。我们发现，一个独特的子集的样品显示协调高甲基化在大量的基因座，表明存在胶质瘤-CpG岛甲基化表型（G-CIMP）。我们在一组非TCGA胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤中验证了G-CIMP。G-CIMP肿瘤属于前神经亚组，在低级别胶质瘤中更普遍，显示出不同的拷贝数改变，并与IDH 1体细胞突变密切相关。患有G-CIMP肿瘤的患者在诊断时更年轻，并且结果显着改善。这些研究结果确定G-CIMP作为一个独特的子集，人类胶质瘤的分子和临床的理由。
We have profiled promoter DNA methylation alterations in 272 glioblastoma tumors in the context of The Cancer Genome Atlas (TCGA). We found that a distinct subset of samples displays concerted hypermethylation at a large number of loci, indicating the existence of a glioma-CpG Island Methylator Phenotype (G-CIMP). We validated G-CIMP in a set of non-TCGA glioblastomas and low-grade gliomas. G-CIMP tumors belong to the Proneural subgroup, are more prevalent among low-grade gliomas, display distinct copy-number alterations and are tightly associated with IDH1 somatic mutations. Patients with G-CIMP tumors are younger at the time of diagnosis and experience significantly improved outcome. These findings identify G-CIMP as a distinct subset of human gliomas on molecular and clinical grounds.
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