Parallel, tag-directed assembly of locally derived short sequence reads.
Parallel, tag-directed assembly of locally derived short sequence reads.
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DOI：
10.1038/nmeth.1416
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发表时间：
2010-02
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Shendure, Jay
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hiatt, Joseph B.;Patwardhan, Rupali P.;Turner, Emily H.;Lee, Choli;Shendure, Jay
我们展示了子组件，一种体外文库构建方法，该方法将短读段测序平台的实用性扩展到需要长读段、准确读段的应用。将长DNA片段文库转化为嵌套子文库的群体，并且标签序列指导来源于相同长片段的短读段的分组，使得能够定位组装长片段序列。亚组装可以促进新基因组的准确组装和宏基因组测序。
We demonstrate subassembly, anin vitrolibrary construction method that extends the utility of short-read sequencing platforms to applications requiring long, accurate reads. A long DNA fragment library is converted to a population of nested sublibraries, and a tag sequence directs grouping of short reads derived from the same long fragment, enabling localized assembly of long fragment sequences. Subassembly may facilitate accuratede novogenome assembly and metagenome sequencing.
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影响因子：
--
作者：
Bentley G;Higuchi R;Hoglund B;Goodridge D;Sayer D;Trachtenberg EA;Erlich HA
通讯作者：
Erlich HA
DOI：
10.1126/science.1170020
发表时间：
2009-05-08
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Weinstein JA;Jiang N;White RA 3rd;Fisher DS;Quake SR
通讯作者：
Quake SR
影响因子：
7
作者：
Simpson, Jared T.;Wong, Kim;Birol, Inanc
通讯作者：
Birol, Inanc
影响因子：
12.3
作者：
Langmead B;Trapnell C;Pop M;Salzberg SL
通讯作者：
Salzberg SL
影响因子：
48
作者：
Mortazavi, Ali;Williams, Brian A.;Wold, Barbara
通讯作者：
Wold, Barbara