MALDI imaging and in situ identification of integral membrane proteins from rat brain tissue sections.
MALDI imaging and in situ identification of integral membrane proteins from rat brain tissue sections.
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DOI：
10.1021/ac400902h
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发表时间：
2013-08-06
影响因子：
7.4
通讯作者：
Caprioli, Richard M.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Nicklay, Joshua J.;Harris, Glenn A.;Schey, Kevin L.;Caprioli, Richard M.
跨膜蛋白在成像质谱（IMS）生成的数据中的代表性大大不足，因为它们的大小和溶解度相关的分析挑战。在这里，我们提出了两个高度修饰的多跨膜结构域蛋白质，髓鞘蛋白脂质蛋白（PLP，30 kDa）和DM-20（26 kDa），从大鼠大脑的各个区域，即大脑，小脑和髓质的MALDI IMS的第一个例子。我们利用一种新的组织预处理，旨在跨膜蛋白富集显示这些蛋白质的脂肪酰化，特别是翻译后棕榈酰化的原位分布。此外，我们证明了蛋白酶封装的水凝胶用于空间定位的组织上的蛋白质消化和肽提取的效用，用于随后直接耦合到LC-MS/MS用于蛋白质鉴定。
Transmembrane proteins are greatly underrepresented in data generated by imaging mass spectrometry (IMS) because of analytical challenges related to their size and solubility. Here we present the first example of MALDI IMS of two highly modified multi-transmembrane domain proteins, myelin proteolipid protein (PLP, 30 kDa) and DM-20 (26 kDa), from various regions of rat brain, namely the cerebrum, cerebellum, and medulla. We utilize a novel tissue pre-treatment aimed at transmembrane protein enrichment to show the in situ distribution of fatty acylation of these proteins, particularly of post-translational palmitoylation. Additionally, we demonstrate the utility of protease-encapsulated hydrogels for spatially localized on-tissue protein digestion and peptide extraction for subsequent direct coupling to LC-MS/MS for protein identification.
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DOI：
10.1073/pnas.0801374105
发表时间：
2008-11-25
影响因子：
11.1
作者：
Seeley, Erin H.;Caprioli, Richard M.
通讯作者：
Caprioli, Richard M.
影响因子：
2.9
作者：
Rabilloud, T;Adessi, C;Lunardi, J
通讯作者：
Lunardi, J
影响因子：
7.4
作者：
Manna, Joseph D.;Reyzer, Michelle L.;Caprioli, Richard M.
通讯作者：
Caprioli, Richard M.
影响因子：
2.3
作者：
ROSINKE, B;STRUPAT, K;GALLA, HJ
通讯作者：
GALLA, HJ
影响因子：
4.8
作者：
Schiffmann, R;van der Knaap, MS
通讯作者：
van der Knaap, MS