Visualizing SNVs to quantify allele-specific expression in single cells.

Visualizing SNVs to quantify allele-specific expression in single cells.
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DOI:
10.1038/nmeth.2589
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发表时间:
2013-09
期刊:
影响因子:
48
通讯作者:
Raj, Arjun
Raj, Arjun
中科院分区:
生物学1区
文献类型:
--
作者:
Levesque, Marshall J.;Ginart, Paul;Wei, Yichen;Raj, Arjun

文献摘要

参考文献

被引文献

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我们提出了一种高效的荧光原位杂交方法,用于检测单个RNA转录本上的单核苷酸变异(SNVs),包括外显子和内含子。我们使用这种方法来量化等位基因表达在人口和单细胞水平,也区分单细胞中的母本和父本染色体。
We present a high efficiency fluorescence in situ hybridization method for detecting single nucleotide variants (SNVs) on individual RNA transcripts, both exonic and intronic. We used this method to quantify allelic expression at the population and single cell level, and also to distinguish maternal from paternal chromosomes in single cells.
DOI: 10.1016/j.ydbio.2005.12.054
发表时间: 2006-04-15
影响因子: 2.7
作者:
Chubb, JR;Bloomfield, G;Singer, RH
通讯作者: Singer, RH
DOI: 10.1038/nmeth.2069
发表时间: 2012-06-03
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期刊: NATURE METHODS
影响因子: 48
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发表时间: 2011-08
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