The landscape of antibody binding in SARS-CoV-2 infection.
The landscape of antibody binding in SARS-CoV-2 infection.
复制标题
SARS-CoV-2感染中抗体结合的景观。
DOI：
10.1371/journal.pbio.3001265
复制
发表时间：
2021-06
期刊：
影响因子：
9.8
通讯作者：
Ong IM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Heffron AS;McIlwain SJ;Amjadi MF;Baker DA;Khullar S;Armbrust T;Halfmann PJ;Kawaoka Y;Sethi AK;Palmenberg AC;Shelef MA;O'Connor DH;Ong IM
针对大流行的严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS - CoV - 2），潜在的基于抗体的诊断方法、疫苗和治疗方法的研究几乎完全集中在刺突（S）蛋白和核衣壳（N）蛋白上。冠状病毒的膜（M）蛋白、ORF3a蛋白和ORF8蛋白在其他冠状病毒（CoVs）中是体液免疫原，但在SARS - CoV - 2方面很大程度上尚未得到研究。在此，我们利用超高密度肽微阵列图谱显示，SARS - CoV - 2感染会诱导针对SARS - CoV - 2整个蛋白质组中表位的强烈抗体反应，特别是在M蛋白中，其中一个表位具有极佳的诊断准确性。我们绘制了SARS - CoV - 2整个蛋白质组中的79个B细胞表位，并证明因SARS - CoV - 2感染而产生的抗体能结合其他6种已知人类冠状病毒中的同源肽序列。我们还通过酶联免疫吸附测定（ELISA）确认了针对我们排名靠前的4个表位的反应性。在我们的研究人群中，疾病严重程度与对S、M、N和ORF3a中的9个SARS - CoV - 2表位的反应性增强相关。我们的研究结果揭示了SARS - CoV - 2整个蛋白质组以及其他冠状病毒蛋白中先前未知的、高反应性的B细胞表位。
对来自未感染个体和新冠肺炎康复者的人类血清与SARS - CoV - 2以及其他人类、蝙蝠和穿山甲冠状病毒的整个蛋白质组的抗体结合情况进行分析，确定了SARS - CoV - 2整个蛋白质组中的79个B细胞表位，发现最敏感和特异的结合发生在膜（M）蛋白上，并揭示了交叉反应模式。
The search for potential antibody-based diagnostics, vaccines, and therapeutics for pandemic severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has focused almost exclusively on the spike (S) and nucleocapsid (N) proteins. Coronavirus membrane (M), ORF3a, and ORF8 proteins are humoral immunogens in other coronaviruses (CoVs) but remain largely uninvestigated for SARS-CoV-2. Here, we use ultradense peptide microarray mapping to show that SARS-CoV-2 infection induces robust antibody responses to epitopes throughout the SARS-CoV-2 proteome, particularly in M, in which 1 epitope achieved excellent diagnostic accuracy. We map 79 B cell epitopes throughout the SARS-CoV-2 proteome and demonstrate that antibodies that develop in response to SARS-CoV-2 infection bind homologous peptide sequences in the 6 other known human CoVs. We also confirm reactivity against 4 of our top-ranking epitopes by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Illness severity correlated with increased reactivity to 9 SARS-CoV-2 epitopes in S, M, N, and ORF3a in our population. Our results demonstrate previously unknown, highly reactive B cell epitopes throughout the full proteome of SARS-CoV-2 and other CoV proteins. Profiling of antibody binding from naïve and COVID-19 convalescent human sera to the entire proteome of SARS-CoV-2 and other human, bat and pangolin coronaviruses identifies 79 B cell epitopes throughout the SARS-CoV-2 proteome, finding that the most sensitive and specific binding occurred in the membrane (M) protein, and revealing cross-reactivity patterns.
登录
查看更多内容
影响因子：
5.8
作者：
Gu, Zuguang;Eils, Roland;Schlesner, Matthias
通讯作者：
Schlesner, Matthias
影响因子：
3.8
作者：
Hai, P;Liu, YG;Rao, ZH
通讯作者：
Rao, ZH
影响因子：
7.5
作者：
Behrens, Georg M. N.;Cossmann, Anne;Jablonka, Alexandra
通讯作者：
Jablonka, Alexandra
特定的 COVID-19 症状与 SARS-CoV-2 的高抗体水平相关。
影响因子：
--
作者：
Amjadi MF;O'Connell SE;Armbrust T;Mergaert AM;Narpala SR;Halfmann PJ;Bashar SJ;Glover CR;Heffron AS;Taylor A;Flach B;O'Connor DH;Kawaoka Y;McDermott AB;Sethi AK;Shelef MA
通讯作者：
Shelef MA
影响因子：
6.4
作者：
Chen, Shuaiyin;Zheng, Xin;Duan, Guangcai
通讯作者：
Duan, Guangcai