FN3-based monobodies selective for the receptor binding domain of the SARS-CoV-2 spike protein.
FN3-based monobodies selective for the receptor binding domain of the SARS-CoV-2 spike protein.
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SARS-COV-2尖峰蛋白的受体结合结构域选择性基于FN3的单体反应。
DOI：
10.1016/j.nbt.2021.01.010
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发表时间：
2021-05-25
影响因子：
5.4
通讯作者：
Kay BK
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Miller CJ;McGinnis JE;Martinez MJ;Wang G;Zhou J;Simmons E;Amet T;Abdeen SJ;Van Huysse JW;Bowsher RR;Kay BK
用SARS-CoV-2病毒刺突蛋白的受体结合结构域（RBD，残基319-541）的生物素化形式亲和选择展示纤连蛋白III型（FN 3）结构域的1010个变体的噬菌体文库。回收了九种结合FN 3变体（即单体），代表四种不同的一级结构。可溶性形式的单体结合到RBD和S1刺突亚基的几种不同制备物上，通过生物层干涉测量法测量的亲和力范围为3至14 nM。四个单抗体中的三个选择性地结合SARS-CoV-2的RBD，第四个单抗体显示出与SARS-CoV-1病毒的RBD的轻微交叉反应性。对刺突片段及其三聚体形式的结合的检查显示，单抗体识别SARS-CoV-2的RBD上至少三个重叠的表位。虽然成对测试未能鉴定可同时结合RBD的单体对，但一个单体可同时结合具有细胞受体血管紧张素转化酶2（ACE 2）的胞外域的RBD。在中国仓鼠卵巢（CHO）细胞中过表达后，所有四种单抗体均成功结合RBD，与人IgG 1的Fc结构域融合。
A phage library displaying 1010 variants of the fibronectin type III (FN3) domain was affinity selected with the biotinylated form of the receptor binding domain (RBD, residues 319–541) of the SARS-CoV-2 virus spike protein. Nine binding FN3 variants (i.e. monobodies) were recovered, representing four different primary structures. Soluble forms of the monobodies bound to several different preparations of the RBD and the S1 spike subunit, with affinities ranging from 3 to 14 nM as measured by bio-layer interferometry. Three of the four monobodies bound selectively to the RBD of SARS-CoV-2, with the fourth monobody showing slight cross-reactivity to the RBD of SARS-CoV-1 virus. Examination of binding to the spike fragments and its trimeric form revealed that the monobodies recognise at least three overlapping epitopes on the RBD of SARS-CoV-2. While pairwise tests failed to identify a monobody pair that could bind simultaneously to the RBD, one monobody could simultaneously bind to the RBD with the ectodomain of the cellular receptor angiotensin converting enzyme 2 (ACE2). All four monobodies successfully bound the RBD after overexpression in Chinese hamster ovary (CHO) cells as fusions to the Fc domain of human IgG1.
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影响因子：
64.8
作者：
Barnes CO;Jette CA;Abernathy ME;Dam KA;Esswein SR;Gristick HB;Malyutin AG;Sharaf NG;Huey-Tubman KE;Lee YE;Robbiani DF;Nussenzweig MC;West AP Jr;Bjorkman PJ
通讯作者：
Bjorkman PJ
影响因子：
64.8
作者：
Ke, Zunlong;Oton, Joaquin;Briggs, John A. G.
通讯作者：
Briggs, John A. G.
影响因子：
5.6
作者：
Birtalan, Sara;Zhang, Yingnan;Sidhu, Sachdev S.
通讯作者：
Sidhu, Sachdev S.
DOI：
10.1016/0928-0197(96)00209-7
发表时间：
1996-05-01
期刊：
CLINICAL AND DIAGNOSTIC VIROLOGY
影响因子：
--
作者：
Grandien, M
通讯作者：
Grandien, M
皮摩尔SARS-COV-2小蛋白抑制剂的从头设计。
DOI：
10.1126/science.abd9909
发表时间：
2020-10-23
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Cao L;Goreshnik I;Coventry B;Case JB;Miller L;Kozodoy L;Chen RE;Carter L;Walls AC;Park YJ;Strauch EM;Stewart L;Diamond MS;Veesler D;Baker D
通讯作者：
Baker D