The complete mitochondrial genome of the common pine vole Terricola subterraneus (Arvicolinae, Rodentia).
The complete mitochondrial genome of the common pine vole Terricola subterraneus (Arvicolinae, Rodentia).
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DOI：
10.1080/23802359.2019.1687026
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发表时间：
2019-11-12
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Abramson NI
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bondareva OV;Abramson NI
本文报道了首次利用Illumina新一代测序（NGS）技术对普通松田鼠地下田鼠（Microtus (Terricola) subterraneus）线粒体全基因组进行测序的结果。有丝分裂基因组全长16398 bp，包含12S、16S rnas、22个tRNAs、13个蛋白编码基因和一个883 bp的d环，具有啮齿类Arvicolinae亚科的特征排列。完整线粒体DNA的总体碱基组成分别为A（33.0%）、C（26.5%）、G（13.4%）和T（27.0%）。线粒体基因组的系统发育分析显示了一个经典的分类单元模式，使用单个系统发育标记进行鉴定。
In this paper, we report the complete mitochondrial genome of the common pine vole Microtus (Terricola) subterraneus, which was sequenced for the first time using Illumina next-generation sequencing (NGS) technology. The total length of the mitogenome was 16,398 bp and contained 12S, 16S rRNAs, 22 tRNAs, 13 protein-coding genes, and a 883 bp D-loop in the characteristic arrangement of subfamily Arvicolinae, Rodentia. Overall base composition of the complete mitochondrial DNA is A (33.0%), C (26.5%), G (13.4%), and T (27.0%), respectively. Phylogenetic analysis of mitochondrial genomes showed a classic taxon pattern, identified using individual phylogenetic markers.
影响因子：
1.7
作者：
Bankevich, Anton;Nurk, Sergey;Pevzner, Pavel A.
通讯作者：
Pevzner, Pavel A.
Trimmomatic：用于 Illumina 序列数据的灵活修剪器。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btu170
发表时间：
2014-08-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Bolger AM;Lohse M;Usadel B
通讯作者：
Usadel B
影响因子：
4.1
作者：
Bernt, Matthias;Donath, Alexander;Stadler, Peter F.
通讯作者：
Stadler, Peter F.