Tilescope: online analysis pipeline for high-density tiling microarray data.
Tilescope: online analysis pipeline for high-density tiling microarray data.
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DOI：
10.1186/gb-2007-8-5-r81
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发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Gerstein M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang ZD;Rozowsky J;Lam HY;Du J;Snyder M;Gerstein M
Tilescope是一种用于分析高密度芯片阵列数据的完全集成且自动化的新型数据处理流程。
我们开发了Tilescope，这是一种用于分析高密度芯片阵列数据的完全集成的数据处理流程。Tilescope以完全自动化的方式对通道间以及不同阵列间的信号进行归一化，合并重复实验，对每个阵列元素进行评分，并识别基因组特征。该程序采用模块化的三层架构设计，便于并行处理，并拥有图形化的用户友好界面，能在一个有条理的网页上展示结果，可供下载以进行进一步分析。
Tilescope is a fully integrated and automated new data-processing pipeline for analyzing high-density tiling-array data. We developed Tilescope, a fully integrated data processing pipeline for analyzing high-density tiling-array data . In a completely automated fashion, Tilescope will normalize signals between channels and across arrays, combine replicate experiments, score each array element, and identify genomic features. The program is designed with a modular, three-tiered architecture, facilitating parallelism, and a graphic user-friendly interface, presenting results in an organized web page, downloadable for further analysis.
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影响因子：
64.5
作者：
Cawley, S;Bekiranov, S;Gingeras, TR
通讯作者：
Gingeras, TR
影响因子：
56.9
作者：
Bertone, P;Stolc, V;Snyder, M
通讯作者：
Snyder, M
DOI：
10.1016/0005-2795(75)90109-9
发表时间：
1975-01-01
期刊：
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA
影响因子：
--
作者：
MATTHEWS, BW
通讯作者：
MATTHEWS, BW
影响因子：
56.9
作者：
Stolc, V;Gauhar, Z;White, KP
通讯作者：
White, KP
DOI：
10.1073/pnas.0408203102
发表时间：
2005-03-22
影响因子：
11.1
作者：
Stolc, V;Samanta, MP;Sussman, MR
通讯作者：
Sussman, MR