Structural insights into the stabilization of MALAT1 noncoding RNA by a bipartite triple helix.
Structural insights into the stabilization of MALAT1 noncoding RNA by a bipartite triple helix.
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DOI：
10.1038/nsmb.2844
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发表时间：
2014-07
影响因子：
16.8
通讯作者：
Steitz JA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Brown JA;Bulkley D;Wang J;Valenstein ML;Yario TA;Steitz TA;Steitz JA
转移相关肺腺癌转录物 1 (MALAT1) 是一种高度丰富的核长非编码 RNA，可促进恶性肿瘤。预计 3'-茎环结构可通过将下游富含 A 的区域接合到三螺旋中来提供稳定性，类似于 KSHV 聚腺苷酸化核 RNA 的表达和核保留元件 (ENE)。人类 MALAT1 ENE 和富含 A 的区域的 3.1-Å 分辨率晶体结构揭示了一个二分三螺旋，其中包含五个和四个 U•A-U 三元组的堆叠，中间由一个 C+•G-C 三元组和 C-G 双元组分隔，并通过两个 A-次要相互作用延伸。体内衰变测定表明，这种平端三螺旋（3' 核苷酸位于 U•A-U 三重结构中）可抑制核 RNA 的快速衰变。 C-G 双峰对三螺旋的中断会引起“螺旋重置”，这解释了为什么自然界中不会出现长度超过 6 的三螺旋堆叠。
Metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1 (MALAT1) is a highly-abundant nuclear long noncoding RNA that promotes malignancy. A 3′-stem-loop structure is predicted to confer stability by engaging a downstream A-rich tract in a triple helix, similar to the expression and nuclear retention element (ENE) from the KSHV polyadenylated nuclear RNA. The 3.1-Å resolution crystal structure of the human MALAT1 ENE and A-rich tract reveals a bipartite triple helix containing stacks of five and four U•A-U triples separated by a C+•G-C triplet and C-G doublet, extended by two A-minor interactions. In vivo decay assays indicate that this blunt-ended triple helix, with the 3′ nucleotide in a U•A-U triple, inhibits rapid nuclear RNA decay. Interruption of the triple helix by the C-G doublet induces a “helical reset” that explains why triple-helical stacks longer than six do not occur in nature.
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影响因子：
4.8
作者：
Henriksson, Niklas;Nilsson, Per;Virtanen, Anders
通讯作者：
Virtanen, Anders
影响因子：
2.9
作者：
Leitner, D;Schröder, W;Weisz, K
通讯作者：
Weisz, K
影响因子：
14.9
作者：
Holland, JA;Hoffman, DW
通讯作者：
Hoffman, DW
DOI：
10.1073/pnas.081082398
发表时间：
2001-04-24
影响因子：
11.1
作者：
Nissen, P;Ippolito, JA;Steitz, TA
通讯作者：
Steitz, TA
影响因子：
11.4
作者：
Conrad, NK;Steitz, JA
通讯作者：
Steitz, JA