MicroRNA gene dosage alterations and drug response in lung cancer.
MicroRNA gene dosage alterations and drug response in lung cancer.
复制标题
DOI：
10.1155/2011/474632
复制
发表时间：
2011
影响因子：
--
通讯作者：
Chari R
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Enfield KS;Stewart GL;Pikor LA;Alvarez CE;Lam S;Lam WL;Chari R
化疗耐药是肺癌患者预后不良的主要原因。虽然大多数研究都集中在蛋白质编码基因的序列突变和表达变化，但最近的报告表明，microRNA（miRNA）表达变化在化疗反应中也起着重要作用。然而，在化疗反应的背景下，在miRNA位点的遗传改变的作用还有待研究。在这项研究中，我们展示了一个综合的，多维的方法，以确定与化疗耐药和敏感性利用公开的药物反应，miRNA位点拷贝数，miRNA表达，mRNA表达数据从独立的资源相关的miRNA的应用。通过煽动一个合乎逻辑的逐步策略，我们已经确定了特定的miRNA与耐药性的几种化疗药物，并提供了一个证明的原则演示如何利用这些不同的数据库，以获得相关的药物基因组学结果。
Chemotherapy resistance is a key contributor to the dismal prognoses for lung cancer patients. While the majority of studies have focused on sequence mutations and expression changes in protein-coding genes, recent reports have suggested that microRNA (miRNA) expression changes also play an influential role in chemotherapy response. However, the role of genetic alterations at miRNA loci in the context of chemotherapy response has yet to be investigated. In this study, we demonstrate the application of an integrative, multidimensional approach in order to identify miRNAs that are associated with chemotherapeutic resistance and sensitivity utilizing publicly available drug response, miRNA loci copy number, miRNA expression, and mRNA expression data from independent resources. By instigating a logical stepwise strategy, we have identified specific miRNAs that are associated with resistance to several chemotherapeutic agents and provide a proof of principle demonstration of how these various databases may be exploited to derive relevant pharmacogenomic results.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1158/1078-0432.ccr-08-3131
发表时间：
2009-04-15
期刊：
Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
影响因子：
--
作者：
Avissar M;Christensen BC;Kelsey KT;Marsit CJ
通讯作者：
Marsit CJ
SIGMA2：癌症基因组，表观基因组和转录组综合基因组多维分析的系统。
影响因子：
3
作者：
Chari, Raj;Coe, Bradley P.;Wedseltoft, Craig;Benetti, Marie;Wilson, Ian M.;Vucic, Emily A.;MacAulay, Calum;Ng, Raymond T.;Lam, Wan L.
通讯作者：
Lam, Wan L.
影响因子：
3.6
作者：
Chuang, Jody C.;Jones, Peter A.
通讯作者：
Jones, Peter A.
影响因子：
3.7
作者：
Buys, Timon P. H.;Chari, Raj;Ling, Victor
通讯作者：
Ling, Victor
影响因子：
6
作者：
Chen, Jiamin;Feilotter, Harriet E.;Tron, Victor A.
通讯作者：
Tron, Victor A.