selscan 2.0: scanning for sweeps in unphased data.
selscan 2.0: scanning for sweeps in unphased data.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btae006
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发表时间：
2024-01-02
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中科院分区：
文献类型：
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作者：
用于识别基因组中最近或正在进行的正选择的几种流行的基于单倍型的统计数据需要单倍型阶段的知识。在这里，我们提供了 selscan 的更新，它实现了这些统计数据的重新定义，以便在非定相数据中使用。源代码和二进制文件可在 https://github.com/szpiech/selscan 上免费获取，以 C/C++ 实现，并在 Linux、Windows 和 MacOS 上受支持。
Several popular haplotype-based statistics for identifying recent or ongoing positive selection in genomes require knowledge of haplotype phase. Here, we provide an update to selscan which implements a re-definition of these statistics for use in unphased data. Source code and binaries are freely available at https://github.com/szpiech/selscan, implemented in C/C++, and supported on Linux, Windows, and MacOS.
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