Shared transcriptional profiles of atypical B cells suggest common drivers of expansion and function in malaria, HIV, and autoimmunity.
Shared transcriptional profiles of atypical B cells suggest common drivers of expansion and function in malaria, HIV, and autoimmunity.
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DOI：
10.1126/sciadv.abg8384
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发表时间：
2021-05
期刊：
影响因子：
13.6
通讯作者：
Madi A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Holla P;Dizon B;Ambegaonkar AA;Rogel N;Goldschmidt E;Boddapati AK;Sohn H;Sturdevant D;Austin JW;Kardava L;Yuesheng L;Liu P;Moir S;Pierce SK;Madi A
非典型 B 细胞代表 IFN-γ 驱动的 B 细胞谱系，该谱系可能在疟疾、HIV 和自身免疫性疾病中类似地扩展。慢性传染病对人类 B 细胞区室具有重大影响，包括 B 细胞显着扩增，此处称为非典型 B 细胞 (ABC)。使用无偏单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq)，我们发现并表征了幼稚 B 细胞、经典记忆 B 细胞和 ABC 亚群的异质性。我们在疟疾、HIV 和自身免疫性疾病中展示了 ABC 簇的非常相似的转录谱，并证明干扰素-γ 驱动了疟疾中 ABC 的扩展。这些观察结果表明，ABC 代表一个独立的 B 细胞谱系，具有共同的诱导物，可进一步多样化并获得疾病特异性特征和功能。在疟疾中，我们根据同种型表达确定了 ABC 子集，这些同种型表达在非洲儿童中的扩增和 B 细胞受体库特征方面有所不同。特别令人感兴趣的是，IgD+IgMlo 和 IgD−IgG+ ABC 获得了高抗原亲和力激活阈值，这表明 ABC 可能限制慢性疟疾中对低亲和力自身抗原的自身免疫反应。
Atypical B cells represent an IFN-γ–driven B cell lineage that may be similarly expanded in malaria, HIV, and autoimmunity. Chronic infectious diseases have a substantial impact on the human B cell compartment including a notable expansion of B cells here termed atypical B cells (ABCs). Using unbiased single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), we uncovered and characterized heterogeneities in naïve B cell, classical memory B cells, and ABC subsets. We showed remarkably similar transcriptional profiles for ABC clusters in malaria, HIV, and autoimmune diseases and demonstrated that interferon-γ drove the expansion of ABCs in malaria. These observations suggest that ABCs represent a separate B cell lineage with a common inducer that further diversifies and acquires disease-specific characteristics and functions. In malaria, we identified ABC subsets based on isotype expression that differed in expansion in African children and in B cell receptor repertoire characteristics. Of particular interest, IgD+IgMlo and IgD−IgG+ ABCs acquired a high antigen affinity threshold for activation, suggesting that ABCs may limit autoimmune responses to low-affinity self-antigens in chronic malaria.
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Xiao Y
DOI：
10.4049/jimmunol.1600491
发表时间：
2016-11-15
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Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
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Meckes, David G., Jr.