Pathways of thymidine hypermodification.
Pathways of thymidine hypermodification.
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DOI：
10.1093/nar/gkab781
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发表时间：
2022-04-08
影响因子：
14.9
通讯作者：
Weigele PR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lee YJ;Dai N;Müller SI;Guan C;Parker MJ;Fraser ME;Walsh SE;Sridar J;Mulholland A;Nayak K;Sun Z;Lin YC;Comb DG;Marks K;Gonzalez R;Dowling DP;Bandarian V;Saleh L;Corrêa IR;Weigele PR
已知细菌病毒的DNA含有对胸苷的多种化学复杂修饰，以保护它们免受其细胞宿主的基于核酸内切酶的防御，但其生物合成来源是谜。在假单胞菌噬菌体M6、沙门氏菌噬菌体VII和其他噬菌体中，多达一半的胸苷含有通过5-羟甲基尿苷（5-hmdU）的复制后修饰合成的外来化学部分。我们已经确定，这些胸苷超修饰来自于5-hmdU上酶促安装的游离氨基酸。这些附加的氨基酸进一步由各种酶类如自由基SAM异构酶、PLP依赖性脱羧酶、黄素依赖性裂解酶和乙酰基转移酶来雕刻。在来自地理上广泛来源的病毒宏基因组中发现的胸苷超修饰基因的组合排列表明DNA超修饰中化学多样性的未开发的水库。胸苷超修饰途径。
The DNAs of bacterial viruses are known to contain diverse, chemically complex modifications to thymidine that protect them from the endonuclease-based defenses of their cellular hosts, but whose biosynthetic origins are enigmatic. Up to half of thymidines in the Pseudomonas phage M6, the Salmonella phage ViI, and others, contain exotic chemical moieties synthesized through the post-replicative modification of 5-hydroxymethyluridine (5-hmdU). We have determined that these thymidine hypermodifications are derived from free amino acids enzymatically installed on 5-hmdU. These appended amino acids are further sculpted by various enzyme classes such as radical SAM isomerases, PLP-dependent decarboxylases, flavin-dependent lyases and acetyltransferases. The combinatorial permutations of thymidine hypermodification genes found in viral metagenomes from geographically widespread sources suggests an untapped reservoir of chemical diversity in DNA hypermodifications. Pathways of thymidine hypermodification.
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影响因子：
5.5
作者：
Benjdia A;Balty C;Berteau O
通讯作者：
Berteau O
影响因子：
14.8
作者：
Kelley LA;Mezulis S;Yates CM;Wass MN;Sternberg MJ
通讯作者：
Sternberg MJ
影响因子：
5.2
作者：
Flodman K;Corrêa IR Jr;Dai N;Weigele P;Xu SY
通讯作者：
Xu SY
影响因子：
14.9
作者：
Iyer LM;Zhang D;Burroughs AM;Aravind L
通讯作者：
Aravind L
DOI：
10.1007/978-1-0716-0876-0_5
发表时间：
2021-01-01
期刊：
DNA MODIFICATIONS
影响因子：
--
作者：
Lee, Yan-Jiun;Weigele, Peter R.
通讯作者：
Weigele, Peter R.