Complete plastome sequence of Lysimachia congestiflora Hemsl. a medicinal and ornamental species in Southern China.
Complete plastome sequence of Lysimachia congestiflora Hemsl. a medicinal and ornamental species in Southern China.
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DOI：
10.1080/23802359.2019.1627952
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发表时间：
2019-07-11
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Tan FL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Li HL;Cheng XL;Chen Y;Tan FL
密花金钱草为报春花科多年生草本植物。主要分布在长江以南和山西、甘肃、台湾以南的省份。它是一种集药用、观赏和经济价值于一体的植物。到目前为止，还没有人对密花乳杆菌的基因组进行研究。在此，我们报道并分析了密花乳杆菌的完整的叶绿体基因组序列，以期为促进其保护提供基因组资源。密花锦鸡儿叶绿体基因组全长154,505 ，具有典型的四分体结构，由一个大的单复制区(LSC，84,606 BP)、一个单复制区(SSC，17,961 BP)和一对反向重复序列(IR，25,969 BP)组成。共有114个注释基因，包括80个独特的蛋白质编码基因、4个独特的核糖体RNA基因和30个转移RNA基因。为了研究密穗莲属和报春花科植物的进化现状，我们根据密穗莲属和其他11个物种的完整叶绿体基因组构建了一个系统发育树。从系统发育拓扑结构来看，密花乳杆菌与空心乳杆菌的亲缘关系较近。
Lysimachia congestiflora Hemsl. is a perennial herb of Primulaceae. It is mainly distributed in the provinces to the south of the Changjiang River and south of Shanxi, Gansu province and Taiwan. It is a plant that combines medicinal, ornamental, and economic values. To date no study has been carried out on the genome of L. congestiflora. Here, we report and characterize the complete plastid genome sequence of L. congestiflora in order to provide genomic resources useful for promoting its conservation. The complete chloroplast genome of L. congestiflora is 154,505 bp in length with a typical quadripartite structure, consisting of a large single-copy region (LSC, 84,606 bp), a single-copy region (SSC, 17,961 bp), and a pair of inverted repeats (IRs, 25,969 bp). There are 114 annotated genes, including 80 unique protein-coding genes, 4 unique ribosomal RNA genes, and 30 transfer RNA genes. To investigate the evolution status of L. congestiflora, as well as Primulaceae, we constructed a phylogenetic tree with L. congestiflora and other 11 species based on their complete chloroplast genomes. According to the phylogenetic topologies, L. congestiflora was closely related to L. coreana.
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作者：
Wyman, SK;Jansen, RK;Boore, JL
通讯作者：
Boore, JL
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Stamatakis, Alexandros
通讯作者：
Stamatakis, Alexandros
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作者：
Li, Ruiqiang;Yu, Chang;Wang, Jun
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Wang, Jun
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作者：
Zuo, Hongliang;Li, Haoyang;Xu, Xiaopeng
通讯作者：
Xu, Xiaopeng
DOI：
10.1080/23802359.2016.1174084
发表时间：
2016-06-20
期刊：
Mitochondrial DNA. Part B, Resources
影响因子：
--
作者：
Liu J;Niu YF;Liu SH;Ni SB
通讯作者：
Ni SB