Dissection of structural dynamics of chromatin fibers by single-molecule magnetic tweezers
Dissection of structural dynamics of chromatin fibers by single-molecule magnetic tweezers
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单分子磁镊解剖染色质纤维的结构动力学
DOI：
10.1007/s41048-018-0064-0
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发表时间：
2018-08
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Wei Li
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Xue Xiao;Liping Dong;Yi-Zhou Wang;Peng-Ye Wang;Ming Li;Guohong Li;Ping Chen;Wei Li
基因组DNA的可及性，作为基因相关过程的关键决定因素，取决于染色质纤维的堆积密度和结构动力学。然而，由于染色质纤维的高度动态性和异质性，研究染色质的这些性质在技术上具有挑战性。在这里，我们报告了一种基于单分子磁镊的染色质纤维动态解剖策略。利用磁镊技术，我们可以操纵染色质纤维，并跟踪其在张力下折叠和展开过程中的伸展，以研究单分子水平上的动态结构转变。高准确性和可靠性的体外单分子策略为研究基因表达过程中染色质纤维的结构动力学及其受不同表观遗传因子的调控提供了一个新的研究平台。
The accessibility of genomic DNA, as a key determinant of gene-related processes, is dependent on the packing density and structural dynamics of chromatin fiber. However, due to the highly dynamic and heterogeneous properties of chromatin fiber, it is technically challenging to study these properties of chromatin. Here, we report a strategy for dissecting the dynamics of chromatin fibers based on single-molecule magnetic tweezers. Using magnetic tweezers, we can manipulate the chromatin fiber and trace its extension during the folding and unfolding process under tension to investigate the dynamic structural transitions at single-molecule level. The highly accurate and reliablein vitrosingle-molecule strategy provides a new research platform to dissect the structural dynamics of chromatin fiber and its regulation by different epigenetic factors during gene expression.
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DOI：
10.15252/embj.201797596
发表时间：
2017-12-01
期刊：
The EMBO journal
影响因子：
--
作者：
Eeftens JM;Bisht S;Kerssemakers J;Kschonsak M;Haering CH;Dekker C
通讯作者：
Dekker C
影响因子：
16.6
作者：
Huhle, Alexander;Klaue, Daniel;Brutzer, Hergen;Daldrop, Peter;Joo, Sihwa;Otto, Oliver;Keyser, Ulrich F.;Seidel, Ralf
通讯作者：
Seidel, Ralf
影响因子：
11.4
作者：
Fulconis, Renaud;Mine, Judith;Viovy, Jean-Louis
通讯作者：
Viovy, Jean-Louis
使用冷冻电镜对二十面体病毒内的基因组和相关蛋白进行对称失配重建
DOI：
10.1007/s41048-016-0024-5
发表时间：
2016-05
期刊：
Biophys Rep
影响因子：
--
作者：
Xiaowu Li;Hongrong Liu;Lingpeng Cheng
通讯作者：
Lingpeng Cheng
影响因子：
1.6
作者：
Lansdorp, Bob M.;Saleh, Omar A.
通讯作者：
Saleh, Omar A.