Cell type-specific gene expression differences in complex tissues.
Cell type-specific gene expression differences in complex tissues.
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DOI：
10.1038/nmeth.1439
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发表时间：
2010-04
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Butte, Atul J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Shen-Orr, Shai S.;Tibshirani, Robert;Khatri, Purvesh;Bodian, Dale L.;Staedtler, Frank;Perry, Nicholas M.;Hastie, Trevor;Sarwal, Minnie M.;Davis, Mark M.;Butte, Atul J.
我们描述了微阵列（cssam）的细胞类型特异性意义分析，用于从微阵列数据和相对细胞类型频率分析生物样本中每种细胞类型的差异基因表达。首先，我们用预先设计的混合物验证了cssam，然后将其应用于稳定的移植后肾移植受者和急性移植排斥患者的全血基因表达数据集，揭示了数百种差异表达基因，否则无法检测到。
We describe cell type–specific significance analysis of microarrays (cssam) for analyzing differential gene expression for each cell type in a biological sample from microarray data and relative cell-type frequencies. first, we validated cssam with predesigned mixtures and then applied it to whole-blood gene expression datasets from stable post-transplant kidney transplant recipients and those experiencing acute transplant rejection, which revealed hundreds of differentially expressed genes that were otherwise undetectable.
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DOI：
10.1073/pnas.091062498
发表时间：
2001-04-24
影响因子：
11.1
作者：
Tusher, VG;Tibshirani, R;Chu, G
通讯作者：
Chu, G
DOI：
10.1073/pnas.2536479100
发表时间：
2004-01-13
影响因子：
11.1
作者：
Stuart, RO;Wachsman, W;Mercola, D
通讯作者：
Mercola, D
影响因子：
4.4
作者：
Palmer, Chana;Diehn, Maximilian;Alizadeh, Ash A;Brown, Patrick O
通讯作者：
Brown, Patrick O
影响因子：
3.7
作者：
Abbas AR;Wolslegel K;Seshasayee D;Modrusan Z;Clark HF
通讯作者：
Clark HF
影响因子：
4.6
作者：
Feezor, RJ;Baker, HV;Tompkins, RG
通讯作者：
Tompkins, RG