The UCSC Genome Browser database: update 2011.
The UCSC Genome Browser database: update 2011.
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DOI：
10.1093/nar/gkq963
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发表时间：
2011-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kent WJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fujita PA;Rhead B;Zweig AS;Hinrichs AS;Karolchik D;Cline MS;Goldman M;Barber GP;Clawson H;Coelho A;Diekhans M;Dreszer TR;Giardine BM;Harte RA;Hillman-Jackson J;Hsu F;Kirkup V;Kuhn RM;Learned K;Li CH;Meyer LR;Pohl A;Raney BJ;Rosenbloom KR;Smith KE;Haussler D;Kent WJ
加利福尼亚大学圣克鲁斯基因组浏览器（http://genome.ucsc.edu）在线访问基因组序列和注释数据的数据库，可用于多种生物体。分析公开可用的基因组数据集，对齐序列并在今年发布的功能中上传。新的显示增强功能包括通过使用透明着色的多个Wiggle Tracks的覆盖，用于显示转换的Wiggle数据的选项，“平均+Whiskers”窗口功能，以显示高变焦级别的Wiggle数据以及更多的微阵列数据亮点包括七个新的基因组组件，一个尼安德特尔基因组数据门户，表型和疾病关联数据，人类RNA编辑轨道和斑马鱼保护轨道。
The University of California, Santa Cruz Genome Browser (http://genome.ucsc.edu) offers online access to a database of genomic sequence and annotation data for a wide variety of organisms. The Browser also has many tools for visualizing, comparing and analyzing both publicly available and user-generated genomic data sets, aligning sequences and uploading user data. Among the features released this year are a gene search tool and annotation track drag-reorder functionality as well as support for BAM and BigWig/BigBed file formats. New display enhancements include overlay of multiple wiggle tracks through use of transparent coloring, options for displaying transformed wiggle data, a ‘mean+whiskers’ windowing function for display of wiggle data at high zoom levels, and more color schemes for microarray data. New data highlights include seven new genome assemblies, a Neandertal genome data portal, phenotype and disease association data, a human RNA editing track, and a zebrafish Conservation track. We also describe updates to existing tracks.
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影响因子：
30.8
作者：
Iafrate, AJ;Feuk, L;Lee, C
通讯作者：
Lee, C
影响因子：
9.8
作者：
Miller, David T.;Adam, Margaret P.;Ledbetter, David H.
通讯作者：
Ledbetter, David H.
影响因子：
4.4
作者：
Lamesch P;Li N;Milstein S;Fan C;Hao T;Szabo G;Hu Z;Venkatesan K;Bethel G;Martin P;Rogers J;Lawlor S;McLaren S;Dricot A;Borick H;Cusick ME;Vandenhaute J;Dunham I;Hill DE;Vidal M
通讯作者：
Vidal M
影响因子：
7
作者：
Gerhard, DS;Wagner, L;Collins, FS
通讯作者：
Collins, FS
影响因子：
14.9
作者：
Karolchik, D;Hinrichs, AS;Kent, WJ
通讯作者：
Kent, WJ