A proteomics grade electron transfer dissociation-enabled hybrid linear ion trap-orbitrap mass spectrometer.
A proteomics grade electron transfer dissociation-enabled hybrid linear ion trap-orbitrap mass spectrometer.
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DOI：
10.1021/pr800264t
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发表时间：
2008-08
影响因子：
4.4
通讯作者：
Coon, Joshua J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
McAlister, Graeme C.;Berggren, W. Travis;Griep-Raming, Jens;Horning, Stevan;Makarov, Alexander;Phanstiel, Doug;Stafford, George;Swaney, Danielle L.;Syka, John E. P.;Zabrouskov, Vlad;Coon, Joshua J.
在这里，我们描述了修改的四极线性离子阱轨道阱混合（QLT轨道阱）质谱仪，以适应负化学电离（NCI）源。NCI源用于产生荧蒽自由基阴离子，用于赋予电子转移解离（ETD）。阴离子束稳定、耐用且强度大，因此仅需4 - 8 ms即可将足量试剂注入QLT。在QLT中进行离子/离子反应后，在QLT（速度和灵敏度）或轨道阱（质量分辨率和准确度）中对ETD产物离子进行质荷比（m/z）分析。在这里，我们描述了该设备的物理布局，阴离子传输的参数优化，相关的ETD品质因数的评价，以及该仪器的蛋白质序列分析的应用。所描述的蛋白质组学应用包括复杂肽混合物分析、翻译后修饰（PTM）位点鉴定、同位素编码定量、大肽表征和完整蛋白质分析。从这些实验中，我们得出结论，ETD使能的轨道阱将提供蛋白质组学领域的几个新的机会，并代表了蛋白质序列分析技术的进步。
Here we describe the modification of a quadrupole linear ion trap-orbitrap hybrid (QLT-orbitrap) mass spectrometer to accommodate a negative chemical ionization (NCI) source. The NCI source is used to produce fluoranthene radical anions for imparting electron transfer dissociation (ETD). The anion beam is stable, robust, and intense so that a sufficient amount of reagents can be injected into the QLT in only 4 - 8 ms. Following ion/ion reaction in the QLT, ETD product ions are mass-to-charge (m/z) analyzed in either the QLT (for speed and sensitivity) or the orbitrap (for mass resolution and accuracy). Here we describe the physical layout of this device, parametric optimization of anion transport, an evaluation of relevant ETD figures of merit, and the application of this instrument to protein sequence analysis. Described proteomic applications include complex peptide mixture analysis, post-translational modification (PTM) site identification, isotope-encoded quantitation, large peptide characterization, and intact protein analysis. From these experiments we conclude the ETD-enabled orbitrap will provide the proteomic field with several new opportunities and represents an advance in protein sequence analysis technologies.
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DOI：
10.1073/pnas.0607084104
发表时间：
2007-02-13
影响因子：
11.1
作者：
Chi, An;Huttenhower, Curtis;Hunt, Donald F.
通讯作者：
Hunt, Donald F.
影响因子：
2.7
作者：
Coon, JJ;Syka, JEP;Hunt, DF
通讯作者：
Hunt, DF
DOI：
10.1073/pnas.83.17.6233
发表时间：
1986-09-01
影响因子：
11.1
作者：
HUNT, DF;YATES, JR;HAUER, CR
通讯作者：
HAUER, CR
影响因子：
4.4
作者：
Frank, Ari M.;Savitski, Mikhail M.;Pevzner, Pavel A.
通讯作者：
Pevzner, Pavel A.
影响因子：
7.4
作者：
Martin, SE;Shabanowitz, J;Marto, JA
通讯作者：
Marto, JA