Intrinsically disordered RGG/RG domains mediate degenerate specificity in RNA binding.
Intrinsically disordered RGG/RG domains mediate degenerate specificity in RNA binding.
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本质上无序的RGG/RG结构域介导了RNA结合中的退化特异性。
DOI：
10.1093/nar/gkx460
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发表时间：
2017-07-27
影响因子：
14.9
通讯作者：
Schwartz JC
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ozdilek BA;Thompson VF;Ahmed NS;White CI;Batey RT;Schwartz JC
RGG/RG结构域是人类基因组中第二常见的RNA结合结构域，但其RNA结合特性仍然知之甚少。在这里，我们报告了融合肉瘤（FUS），FMRP和hnRNPU的内在无序RGG/RG结构域的RNA结合特性的详细分析。对于FUS，以前的研究定义RNA结合介导的折叠结构域，然而，我们发现，RGG/RG结构域是主要的介质结合。与相邻折叠结构域偶联的RGG/RG结构域可以实现接近全长FUS的亲和力。对来自FUS、FMRP和hnRNPU的RGG/RG结构域针对对比RNA的光谱的分析揭示，每个显示简并结合特异性，同时仍然显示对RNA的不同程度的偏好。
RGG/RG domains are the second most common RNA binding domain in the human genome, yet their RNA-binding properties remain poorly understood. Here, we report a detailed analysis of the RNA binding characteristics of intrinsically disordered RGG/RG domains from Fused in Sarcoma (FUS), FMRP and hnRNPU. For FUS, previous studies defined RNA binding as mediated by its well-folded domains; however, we show that RGG/RG domains are the primary mediators of binding. RGG/RG domains coupled to adjacent folded domains can achieve affinities approaching that of full-length FUS. Analysis of RGG/RG domains from FUS, FMRP and hnRNPU against a spectrum of contrasting RNAs reveals that each display degenerate binding specificity, while still displaying different degrees of preference for RNA.
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DOI：
10.1007/978-94-007-2172-2_4
发表时间：
2012-01-01
期刊：
INTERPLAY BETWEEN METAL IONS AND NUCLEIC ACIDS
影响因子：
--
作者：
Campbell, Nancy H.;Neidle, Stephen
通讯作者：
Neidle, Stephen
DOI：
10.1073/pnas.1509317112
发表时间：
2015-09-22
影响因子：
11.1
作者：
Berry, Joel;Weber, Stephanie C.;Brangwynne, Clifford P.
通讯作者：
Brangwynne, Clifford P.
RNA 双链体-四链体连接的 FMRP RGG 肽识别的结构功能研究。
影响因子：
16.8
作者：
Anh Tuan Phan;Kuryavyi, Vitaly;Darnell, Jennifer C.;Serganov, Alexander;Majumdar, Ananya;Ilin, Serge;Raslin, Tanya;Polonskaia, Anna;Chen, Cynthia;Clain, David;Darnell, Robert B.;Patel, Dinshaw J.
通讯作者：
Patel, Dinshaw J.
G-四链体折叠和稳定性中的金属阳离子。
影响因子：
5.5
作者：
Bhattacharyya D;Mirihana Arachchilage G;Basu S
通讯作者：
Basu S
DOI：
10.1007/978-1-59745-557-2_9
发表时间：
2009
期刊：
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
影响因子：
--
作者：
Edwards, Andrea L;Garst, Andrew D;Batey, Robert T
通讯作者：
Batey, Robert T