Guiding strand passage: DNA-induced movement of the gyrase C-terminal domains defines an early step in the supercoiling cycle.
Guiding strand passage: DNA-induced movement of the gyrase C-terminal domains defines an early step in the supercoiling cycle.
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DOI：
10.1093/nar/gkr680
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发表时间：
2011-12
影响因子：
14.9
通讯作者：
Klostermeier D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lanz MA;Klostermeier D
DNA促旋酶在链传递机制中催化DNA的ATP依赖性负超螺旋。DNA的双链区段，即T区段，通过促旋酶中三个蛋白质界面的协调关闭和打开而穿过瞬时切割的G区段中的差距。T-片段捕获被认为是由旋转酶的GyrA亚基的C-末端结构域引导的，所述结构域将DNA包裹在其周边周围并引起具有正手性的DNA交叉。我们在这里表明，在没有DNA的情况下，C末端结构域处于向下的方向，但当DNA结合时，C末端结构域会向上摆动并旋转远离促旋酶体。C-末端结构域的向上移动是促旋酶催化循环中的早期事件，其由G-区段的结合和DNA与C-末端结构域的首次接触触发，并且有助于T-区段捕获和随后的链通过。
DNA gyrase catalyzes ATP-dependent negative supercoiling of DNA in a strand passage mechanism. A double-stranded segment of DNA, the T-segment, is passed through the gap in a transiently cleaved G-segment by coordinated closing and opening of three protein interfaces in gyrase. T-segment capture is thought to be guided by the C-terminal domains of the GyrA subunit of gyrase that wrap DNA around their perimeter and cause a DNA-crossing with a positive handedness. We show here that the C-terminal domains are in a downward-facing orientation in the absence of DNA, but swing up and rotate away from the gyrase body when DNA binds. The upward movement of the C-terminal domains is an early event in the catalytic cycle of gyrase that is triggered by binding of a G-segment, and first contacts of the DNA with the C-terminal domains, and contributes to T-segment capture and subsequent strand passage.
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DOI：
10.1073/pnas.93.25.14416
发表时间：
1996-12-10
影响因子：
11.1
作者：
Kampranis, SC;Maxwell, A
通讯作者：
Maxwell, A
影响因子：
14.9
作者：
Hilbert M;Kebbel F;Gubaev A;Klostermeier D
通讯作者：
Klostermeier D
影响因子：
14.9
作者：
Schoeffler AJ;May AP;Berger JM
通讯作者：
Berger JM
DOI：
10.1073/pnas.0401595101
发表时间：
2004-05-11
影响因子：
11.1
作者：
Corbett, KD;Shultzaberger, RK;Berger, JM
通讯作者：
Berger, JM
影响因子：
64.8
作者：
Dong, Ken C.;Berger, James M.
通讯作者：
Berger, James M.