ASHLEYS: automated quality control for single-cell Strand-seq data.
ASHLEYS: automated quality control for single-cell Strand-seq data.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btab221
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发表时间：
2021-10-11
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ebert P
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gros C;Sanders AD;Korbel JO;Marschall T;Ebert P
Single-cell DNA template strand sequencing (Strand-seq) enables chromosome length haplotype phasing, construction of phased assemblies, mapping sister-chromatid exchange events and structural variant discovery. The initial quality control of potentially thousands of single-cell libraries is still done manually by domain experts. ASHLEYS automates this tedious task, delivers near-expert performance and labels even large datasets in seconds. github.com/friendsofstrandseq/ashleys-qc, MIT license. Supplementary data are available at Bioinformatics online.
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影响因子：
7
作者：
Sanders AD;Hills M;Porubský D;Guryev V;Falconer E;Lansdorp PM
通讯作者：
Lansdorp PM
影响因子：
7.7
作者：
Claussin C;Porubský D;Spierings DC;Halsema N;Rentas S;Guryev V;Lansdorp PM;Chang M
通讯作者：
Chang M
DOI：
10.1093/bioinformatics/bty290
发表时间：
2018-07-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Ghareghani M;Porubskỳ D;Sanders AD;Meiers S;Eichler EE;Korbel JO;Marschall T
通讯作者：
Marschall T
影响因子：
14.8
作者：
Sanders, Ashley D.;Falconer, Ester;Lansdorp, Peter M.
通讯作者：
Lansdorp, Peter M.
影响因子：
16.6
作者：
Porubsky D;Garg S;Sanders AD;Korbel JO;Guryev V;Lansdorp PM;Marschall T
通讯作者：
Marschall T