Protein annotation and modelling servers at University College London.
Protein annotation and modelling servers at University College London.
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DOI：
10.1093/nar/gkq427
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发表时间：
2010-07
影响因子：
14.9
通讯作者：
Jones DT
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Buchan DW;Ward SM;Lobley AE;Nugent TC;Bryson K;Jones DT
UCL生物信息学组门户网站提供了多种高质量的蛋白质结构预测和功能注释算法，包括PSIPRED、pGenTHREADER、pDomTHREADER、MEMSAT、MetSite、DISOPRED2、DomPred和FFPred，分别用于预测二级结构、蛋白质折叠、蛋白质结构域、跨膜螺旋拓扑、金属结合位点、蛋白质无序区域、蛋白质域边界和蛋白质功能。我们现在还提供完全自动化的 3D 建模管道：BioSerf，它在 CASP8 中表现良好，并使用片段组装方法，使其跻身从头建模类别中排名前五的服务器。这些服务器可通过该集团网站 http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/ 获得。
The UCL Bioinformatics Group web portal offers several high quality protein structure prediction and function annotation algorithms including PSIPRED, pGenTHREADER, pDomTHREADER, MEMSAT, MetSite, DISOPRED2, DomPred and FFPred for the prediction of secondary structure, protein fold, protein structural domain, transmembrane helix topology, metal binding sites, regions of protein disorder, protein domain boundaries and protein function, respectively. We also now offer a fully automated 3D modelling pipeline: BioSerf, which performed well in CASP8 and uses a fragment-assembly approach which placed it in the top five servers in the de novo modelling category. The servers are available via the group web site at http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/.
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影响因子：
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作者：
Jones, DT;McGuffin, LJ
通讯作者：
McGuffin, LJ
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作者：
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Jones, DT
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Jones, DT