Sex Inclusion in Transcriptome Studies of Daily Rhythms.
Sex Inclusion in Transcriptome Studies of Daily Rhythms.
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DOI：
10.1177/07487304221134160
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发表时间：
2023-02
影响因子：
3.5
通讯作者：
Hughey JJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Obodo D;Outland EH;Hughey JJ
对哺乳动物的生物医学研究传统上忽视了女性，这引起了人们的担忧，即一些科学发现可能难以推广到一半的人口。虽然这种缺乏性别包容性已被广泛记录，其在昼夜节律基因组学中的程度仍然没有描述。为了解决这一差距，我们研究了性别包容的做法，在一个全面的收集公开的转录组研究的日常节奏。在148项具有哺乳动物体内样本的研究中，我们发现女性在生物体和组织中的代表性严重不足。总体而言，123项小鼠研究中只有23项，10项大鼠研究中只有0项，15项人类研究中只有9项包括女性样本。此外，有两性样本的研究中，男性样本往往多于女性样本。随着时间的推移，这些趋势似乎几乎没有变化，包括自2016年以来，美国国立卫生研究院开始要求研究人员将性别视为生物变量。我们的研究结果突出了一个机会，大大提高了女性在昼夜节律研究中的代表性，并在基因组水平上探索日常节律的性别差异。
Biomedical research on mammals has traditionally neglected females, raising the concern that some scientific findings may generalize poorly to half the population. Although this lack of sex inclusion has been broadly documented, its extent within circadian genomics remains undescribed. To address this gap, we examined sex inclusion practices in a comprehensive collection of publicly available transcriptome studies on daily rhythms. Among 148 studies having samples from mammals in vivo, we found strong underrepresentation of females across organisms and tissues. Overall, only 23 of 123 studies in mice, 0 of 10 studies in rats, and 9 of 15 studies in humans included samples from females. In addition, studies having samples from both sexes tended to have more samples from males than from females. These trends appear to have changed little over time, including since 2016, when the US National Institutes of Health began requiring investigators to consider sex as a biological variable. Our findings highlight an opportunity to dramatically improve representation of females in circadian research and to explore sex differences in daily rhythms at the genome level.
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影响因子：
29
作者：
Chaix A;Lin T;Le HD;Chang MW;Panda S
通讯作者：
Panda S
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Belle MD
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作者：
Acosta-Rodriguez, Victoria;Rijo-Ferreira, Filipa;Izumo, Mariko;Xu, Pin;Wight-Carter, Mary;Green, Carla B.;Takahashi, Joseph S.
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Takahashi, Joseph S.
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Blacher, Eran;Tsai, Connie;Litichevskiy, Lev;Shipony, Zohar;Iweka, Chinyere Agbaegbu;Schneider, Kai Markus;Chuluun, Bayarsaikhan;Heller, H. Craig;Menon, Vilas;Thaiss, Christoph A.;Andreasson, Katrin I.
通讯作者：
Andreasson, Katrin I.