Genome-scale embryonic developmental profile of gene expression in the common house spider Parasteatoda tepidariorum.
Genome-scale embryonic developmental profile of gene expression in the common house spider Parasteatoda tepidariorum.
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DOI：
10.1016/j.dib.2018.05.106
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发表时间：
2018-08
期刊：
影响因子：
1.2
通讯作者：
Oda H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Iwasaki-Yokozawa S;Akiyama-Oda Y;Oda H
我们进行了RNA测序（RNA-Seq）在10个连续的发育阶段的常见的家蜘蛛Parasteatoda tepidariorum的胚胎。来自两对亲本的两个独立的数据集表示沿着P. tepidariorum基因组组装的沿着支架的映射的RNA-Seq读数的归一化覆盖。针对现有AUGUSTUS基因模型计算转录物丰度。这些数据集已经以登录号GSE 112712保藏在国家生物技术信息中心（NCBI）的基因表达综合数据库（GEO）中。
We performed RNA sequencing (RNA-Seq) at ten successive developmental stages in embryos of the common house spider Parasteatoda tepidariorum. Two independent datasets from two pairs of parents represent the normalized coverage of mapped RNA-Seq reads along scaffolds of the P. tepidariorum genome assembly. Transcript abundance was calculated against existing AUGUSTUS gene models. The datasets have been deposited in the Gene Expression Omnibus (GEO) Database at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) under the accession number GSE112712.
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影响因子：
5.4
作者：
Schwager EE;Sharma PP;Clarke T;Leite DJ;Wierschin T;Pechmann M;Akiyama-Oda Y;Esposito L;Bechsgaard J;Bilde T;Buffry AD;Chao H;Dinh H;Doddapaneni H;Dugan S;Eibner C;Extavour CG;Funch P;Garb J;Gonzalez LB;Gonzalez VL;Griffiths-Jones S;Han Y;Hayashi C;Hilbrant M;Hughes DST;Janssen R;Lee SL;Maeso I;Murali SC;Muzny DM;Nunes da Fonseca R;Paese CLB;Qu J;Ronshaugen M;Schomburg C;Schönauer A;Stollewerk A;Torres-Oliva M;Turetzek N;Vanthournout B;Werren JH;Wolff C;Worley KC;Bucher G;Gibbs RA;Coddington J;Oda H;Stanke M;Ayoub NA;Prpic NM;Flot JF;Posnien N;Richards S;McGregor AP
通讯作者：
McGregor AP
影响因子：
0.9
作者：
Yamazaki, Kazunori;Akiyama-Oda, Yasuko;Oda, Hiroki
通讯作者：
Oda, Hiroki
影响因子：
4.6
作者：
Akiyama-Oda, Y;Oda, H
通讯作者：
Oda, H
影响因子：
2.4
作者：
Mittmann, Beate;Wolff, Carsten
通讯作者：
Wolff, Carsten