A scaling normalization method for differential expression analysis of RNA-seq data.
A scaling normalization method for differential expression analysis of RNA-seq data.
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DOI：
10.1186/gb-2010-11-3-r25
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发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Oshlack A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Robinson MD;Oshlack A
一种新的和经验的方法，规范化的RNA-seq的数据提供了基于测序的转录组调查的细节表明，RNA-seq很可能成为选择的平台，询问稳态RNA。为了发现生物学上重要的表达变化，我们表明，正常化仍然是分析中的一个重要步骤。我们概述了一个简单而有效的方法进行规范化，并显示显着改善的结果，在模拟和公开可用的数据集推断差异表达。
A novel and empirical method for normalization of RNA-seq data is presented The fine detail provided by sequencing-based transcriptome surveys suggests that RNA-seq is likely to become the platform of choice for interrogating steady state RNA. In order to discover biologically important changes in expression, we show that normalization continues to be an essential step in the analysis. We outline a simple and effective method for performing normalization and show dramatically improved results for inferring differential expression in simulated and publicly available data sets.
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影响因子：
3.7
作者：
de Jonge HJ;Fehrmann RS;de Bont ES;Hofstra RM;Gerbens F;Kamps WA;de Vries EG;van der Zee AG;te Meerman GJ;ter Elst A
通讯作者：
ter Elst A
影响因子：
12.3
作者：
Gentleman RC;Carey VJ;Bates DM;Bolstad B;Dettling M;Dudoit S;Ellis B;Gautier L;Ge Y;Gentry J;Hornik K;Hothorn T;Huber W;Iacus S;Irizarry R;Leisch F;Li C;Maechler M;Rossini AJ;Sawitzki G;Smith C;Smyth G;Tierney L;Yang JY;Zhang J
通讯作者：
Zhang J
影响因子：
48
作者：
Cloonan, Nicole;Forrest, Alistair R. R.;Grimmond, Sean M.
通讯作者：
Grimmond, Sean M.
影响因子：
14.9
作者：
't Hoen PA;Ariyurek Y;Thygesen HH;Vreugdenhil E;Vossen RH;de Menezes RX;Boer JM;van Ommen GJ;den Dunnen JT
通讯作者：
den Dunnen JT
影响因子：
3
作者：
Vêncio RZ;Brentani H;Patrão DF;Pereira CA
通讯作者：
Pereira CA