Decreasing miRNA sequencing bias using a single adapter and circularization approach.
Decreasing miRNA sequencing bias using a single adapter and circularization approach.
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DOI：
10.1186/s13059-018-1488-z
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发表时间：
2018-09-03
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Kazakov SA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Barberán-Soler S;Vo JM;Hogans RE;Dallas A;Johnston BH;Kazakov SA
准确量化样本中所有微小核糖核酸（miRNAs）的能力对于理解miRNA生物学以及开发新的生物标志物和治疗靶点非常重要。我们开发了一种制备miRNA测序文库的新方法，即RealSeq® - AC，该方法包括用单个衔接子连接miRNAs，并使连接产物环化。与其他方法相比，RealSeq® - AC大大降低了miRNA测序偏差，并能够识别生物样本中种类最多的miRNAs。这种降低的偏差还能够对不同RNA输入水平的样本中存在的miRNAs进行可靠的定量。
本文的在线版本（10.1186/s13059 - 2018 - 1488 - z）包含补充材料，授权用户可获取。
The ability to accurately quantify all the microRNAs (miRNAs) in a sample is important for understanding miRNA biology and for development of new biomarkers and therapeutic targets. We develop a new method for preparing miRNA sequencing libraries, RealSeq®-AC, that involves ligating the miRNAs with a single adapter and circularizing the ligation products. When compared to other methods, RealSeq®-AC provides greatly reduced miRNA sequencing bias and allows the identification of the largest variety of miRNAs in biological samples. This reduced bias also allows robust quantification of miRNAs present in samples across a wide range of RNA input levels. The online version of this article (10.1186/s13059-018-1488-z) contains supplementary material, which is available to authorized users.
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microRNA分析：方法和考虑因素。
DOI：
10.1038/nrg3198
发表时间：
2012-04-18
期刊：
Nature reviews. Genetics
影响因子：
--
作者：
Pritchard CC;Cheng HH;Tewari M
通讯作者：
Tewari M
影响因子：
48
作者：
Langmead, Ben;Salzberg, Steven L.
通讯作者：
Salzberg, Steven L.
影响因子：
7.3
作者：
Chugh, Pauline;Dittmer, Dirk P.
通讯作者：
Dittmer, Dirk P.
影响因子：
4.5
作者：
Leshkowitz, Dena;Horn-Saban, Shirley;Feldmesser, Ester
通讯作者：
Feldmesser, Ester
影响因子：
3.5
作者：
Tian G;Yin X;Luo H;Xu X;Bolund L;Zhang X;Gan SQ;Li N
通讯作者：
Li N