Ensembl 2009.
Ensembl 2009.
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Ensembl 2009。
DOI：
10.1093/nar/gkn828
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发表时间：
2009-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Flicek P
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hubbard TJ;Aken BL;Ayling S;Ballester B;Beal K;Bragin E;Brent S;Chen Y;Clapham P;Clarke L;Coates G;Fairley S;Fitzgerald S;Fernandez-Banet J;Gordon L;Graf S;Haider S;Hammond M;Holland R;Howe K;Jenkinson A;Johnson N;Kahari A;Keefe D;Keenan S;Kinsella R;Kokocinski F;Kulesha E;Lawson D;Longden I;Megy K;Meidl P;Overduin B;Parker A;Pritchard B;Rios D;Schuster M;Slater G;Smedley D;Spooner W;Spudich G;Trevanion S;Vilella A;Vogel J;White S;Wilder S;Zadissa A;Birney E;Cunningham F;Curwen V;Durbin R;Fernandez-Suarez XM;Herrero J;Kasprzyk A;Proctor G;Smith J;Searle S;Flicek P
Ensembl项目（http://www.ensembl.org）是一个全面的基因组信息系统，其中包含一组集成的基因组注释，数据库和其他有关Chordate的信息，可选的模型有机体和疾病媒介基因组。截至第51版（2008年11月），Ensembl完全支持45种，另外三种物种具有初步支持。过去一年中的新物种包括猩猩和六个额外的低覆盖哺乳动物基因组。由于我们先前的报告包括对我们网站的重大重新设计，因此对Ensembl的重大补充和改进；使用新的ENREDO-PECAN-ORTHEUS管道以及我们软件基础架构的开发，特别是为了支持ENSEMBL基因组项目（http://www.ensemblgenomes.org/），使用新的enredo-pecan-ortheus管道以及我们软件基础架构的开发生成多个基因组比对和祖先序列。
The Ensembl project (http://www.ensembl.org) is a comprehensive genome information system featuring an integrated set of genome annotation, databases, and other information for chordate, selected model organism and disease vector genomes. As of release 51 (November 2008), Ensembl fully supports 45 species, and three additional species have preliminary support. New species in the past year include orangutan and six additional low coverage mammalian genomes. Major additions and improvements to Ensembl since our previous report include a major redesign of our website; generation of multiple genome alignments and ancestral sequences using the new Enredo-Pecan-Ortheus pipeline and development of our software infrastructure, particularly to support the Ensembl Genomes project (http://www.ensemblgenomes.org/).
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Flicek P;Aken BL;Beal K;Ballester B;Caccamo M;Chen Y;Clarke L;Coates G;Cunningham F;Cutts T;Down T;Dyer SC;Eyre T;Fitzgerald S;Fernandez-Banet J;Gräf S;Haider S;Hammond M;Holland R;Howe KL;Howe K;Johnson N;Jenkinson A;Kähäri A;Keefe D;Kokocinski F;Kulesha E;Lawson D;Longden I;Megy K;Meidl P;Overduin B;Parker A;Pritchard B;Prlic A;Rice S;Rios D;Schuster M;Sealy I;Slater G;Smedley D;Spudich G;Trevanion S;Vilella AJ;Vogel J;White S;Wood M;Birney E;Cox T;Curwen V;Durbin R;Fernandez-Suarez XM;Herrero J;Hubbard TJ;Kasprzyk A;Proctor G;Smith J;Ureta-Vidal A;Searle S
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Gibbs, Richard A.;Rogers, Jeffrey;Zwieg, Ann S.
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