RNA cytometry of single-cells using semi-permeable microcapsules.
RNA cytometry of single-cells using semi-permeable microcapsules.
复制标题
DOI：
10.1093/nar/gkac918
复制
发表时间：
2023-01-11
影响因子：
14.9
通讯作者：
Mazutis, Linas
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Leonaviciene, Greta;Mazutis, Linas
单个细胞基因表达谱的分析工具对于研究复杂的生物系统至关重要。然而，能够快速测量数千个单细胞上的基因表达的技术是缺乏的。在这里，我们报告了一种高通量RNA细胞术，用于分离被薄的半透膜(微囊)包裹的液滴中的单细胞的数字轮廓。由于膜的选择性渗透性，通过简单地改变分散微胶囊的反应缓冲液，可以在任何给定步骤将所需的酶和试剂装载或替换到微胶囊中。因此，复杂的分子生物学工作流程可以很容易地适用于对被包裹的哺乳动物细胞或其他生物物种进行核酸分析。该微胶囊支持连续的多步骤酶反应，并在不同的生化条件下保持完好，冷冻、解冻和热循环。将微胶囊与传统的流式细胞仪相结合，提供了一种高通量的方法，用于基于细胞的数字基因表达签名对单个细胞进行RNA细胞术。
Analytical tools for gene expression profiling of individual cells are critical for studying complex biological systems. However, the techniques enabling rapid measurements of gene expression on thousands of single-cells are lacking. Here, we report a high-throughput RNA cytometry for digital profiling of single-cells isolated in liquid droplets enveloped by a thin semi-permeable membrane (microcapsules). Due to the selective permeability of the membrane, the desirable enzymes and reagents can be loaded, or replaced, in the microcapsule at any given step by simply changing the reaction buffer in which the microcapsules are dispersed. Therefore, complex molecular biology workflows can be readily adapted to conduct nucleic acid analysis on encapsulated mammalian cells, or other biological species. The microcapsules support sequential multi-step enzymatic reactions and remain intact under different biochemical conditions, freezing, thawing, and thermocycling. Combining microcapsules with conventional FACS provides a high-throughput approach for conducting RNA cytometry of individual cells based on their digital gene expression signature.
登录
查看更多内容
影响因子：
12.8
作者：
Chen X;Wang F;Zhang Y;Ma X;Cao P;Yuan L;Wang L;Chen J;Zhou X;Wu Q;Liu M;Jin D;Liu H
通讯作者：
Liu H
影响因子：
64.5
作者：
Durruthy-Durruthy R;Gottlieb A;Hartman BH;Waldhaus J;Laske RD;Altman R;Heller S
通讯作者：
Heller S
影响因子：
5.3
作者：
Hietakangas, V;Poukkula, M;Eriksson, JE
通讯作者：
Eriksson, JE
影响因子：
9.4
作者：
Craney, Arryn R.;Velu, Priya D.;Westblade, Lars F.
通讯作者：
Westblade, Lars F.
影响因子：
14.8
作者：
Arrigucci R;Bushkin Y;Radford F;Lakehal K;Vir P;Pine R;Martin D;Sugarman J;Zhao Y;Yap GS;Lardizabal AA;Tyagi S;Gennaro ML
通讯作者：
Gennaro ML