Encapsulation of a polymer by an icosahedral virus.
Encapsulation of a polymer by an icosahedral virus.
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DOI：
10.1088/1478-3975/7/4/045003
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发表时间：
2010-12-09
期刊：
影响因子：
2
通讯作者：
Hagan MF
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Elrad OM;Hagan MF
许多病毒的外壳蛋白自发地在核酸或其他聚合物周围形成二十面体衣壳。阐明包装的聚合物在衣壳形成中的作用可以促进生物医学工作，以阻止病毒复制，并使衣壳能够用于纳米材料应用。为此，我们执行布朗动力学的粗粒度模型，描述了二十面体衣壳组装周围的柔性聚合物的动力学。我们确定了几种机制，聚合物在其封装中发挥积极作用，包括合作的聚合物-蛋白质运动。这些机制与实验可控参数有关，如聚合物长度、蛋白质浓度和溶液条件。此外，模拟表明，组装机制与封装效率相关，我们提出了一个相图，预测组装结果作为实验参数的函数。我们预计，我们的模拟结果将提供一个框架，设计在体外组装实验的单链RNA病毒衣壳。
The coat proteins of many viruses spontaneously form icosahedral capsids around nucleic acids or other polymers. Elucidating the role of the packaged polymer in capsid formation could promote biomedical efforts to block viral replication and enable use of capsids in nanomaterials applications. To this end, we perform Brownian dynamics on a coarse-grained model that describes the dynamics of icosahedral capsid assembly around a flexible polymer. We identify several mechanisms by which the polymer plays an active role in its encapsulation, including cooperative polymer-protein motions. These mechanisms are related to experimentally controllable parameters such as polymer length, protein concentration, and solution conditions. Furthermore, the simulations demonstrate that assembly mechanisms are correlated to encapsulation efficiency, and we present a phase diagram that predicts assembly outcomes as a function of experimental parameters. We anticipate that our simulation results will provide a framework for designing in vitro assembly experiments on single-stranded RNA virus capsids.
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影响因子：
2.9
作者：
Ceres, P;Zlotnick, A
通讯作者：
Zlotnick, A
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作者：
Devkota, Batsal;Petrov, Anton S.;Harvey, Stephen C.
通讯作者：
Harvey, Stephen C.
影响因子：
10.8
作者：
Chen, C;Daniel, MC;Dragnea, B
通讯作者：
Dragnea, B
影响因子：
3.4
作者：
Ben-Tal, N;Honig, B;Ben-Shaul, A
通讯作者：
Ben-Shaul, A
DOI：
10.1006/smvy.1994.1006
发表时间：
1994-02-01
期刊：
SEMINARS IN VIROLOGY
影响因子：
--
作者：
FOX, JM;JOHNSON, JE;YOUNG, MJ
通讯作者：
YOUNG, MJ