Complemented Palindromic Small RNAs First Discovered from SARS Coronavirus.
Complemented Palindromic Small RNAs First Discovered from SARS Coronavirus.
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作者：
Liu C;Chen Z;Hu Y;Ji H;Yu D;Shen W;Li S;Ruan J;Bu W;Gao S
在这项研究中，我们首次报道了互补回文小RNA（cpsRNA）的存在，并提出cpsRNA和回文小RNA（psRNA）构成了一类新型小RNA。第一个发现的 19-nt cpsRNA UUAACAAGCUUGUUAAAGA，命名为 SARS-CoV-cpsR-19，是从严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）基因组中的 22 bp DNA 互补回文 TCTTTAACAAGCTTGTTAAAGA 中检测到的。系统发育分析支持该DNA互补回文源于蝙蝠β冠状病毒。 RNA干扰（RNAi）实验结果表明，SARS-CoV-cpsR-19对应的一个19-nt片段显着诱导细胞凋亡。通过对分子功能和系统发育的联合分析，我们的结果表明 SARS-CoV-cpsR-19 可能在 SARS-CoV 感染或发病机制中发挥作用。 cpsRNA 的发现为寻找新的病原体检测标记物并从不同的角度揭示感染或发病机制奠定了基础。当无法获得致病病毒时，研究人员可以使用 cpsRNA 研究这些病毒的感染或发病机制。 psRNA 和 cpsRNA 作为一类新型小 RNA 的发现也激发了研究人员研究病毒基因组中 DNA 回文结构以及与 psRNA 和 cpsRNA 长度互补的 DNA 回文结构。
In this study, we report for the first time the existence of complemented palindromic small RNAs (cpsRNAs) and propose that cpsRNAs and palindromic small RNAs (psRNAs) constitute a novel class of small RNAs. The first discovered 19-nt cpsRNA UUAACAAGCUUGUUAAAGA, named SARS-CoV-cpsR-19, was detected from a 22-bp DNA complemented palindrome TCTTTAACAAGCTTGTTAAAGA in the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) genome. The phylogenetic analysis supported that this DNA complemented palindrome originated from bat betacoronavirus. The results of RNA interference (RNAi) experiments showed that one 19-nt segment corresponding to SARS-CoV-cpsR-19 significantly induced cell apoptosis. Using this joint analysis of the molecular function and phylogeny, our results suggested that SARS-CoV-cpsR-19 could play a role in SARS-CoV infection or pathogenesis. The discovery of cpsRNAs has paved a way to find novel markers for pathogen detection and to reveal the mechanisms underlying infection or pathogenesis from a different point of view. Researchers can use cpsRNAs to study the infection or pathogenesis of pathogenic viruses when these viruses are not available. The discovery of psRNAs and cpsRNAs, as a novel class of small RNAs, also inspire researchers to investigate DNA palindromes and DNA complemented palindromes with lengths of psRNAs and cpsRNAs in viral genomes.
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影响因子：
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作者：
Wang F;Sun Y;Ruan J;Chen R;Chen X;Chen C;Kreuze JF;Fei Z;Zhu X;Gao S
通讯作者：
Gao S
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30.3
作者：
Morales L;Oliveros JC;Fernandez-Delgado R;tenOever BR;Enjuanes L;Sola I
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Sola I
rRNA 衍生的 RNA 片段 (rRF) 的两个特征系列构成了一类新型小 RNA
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