Complete mitochondrial genome of Ciconia nigra (Ciconiiformes: Ciconiidae), a threatened stork in China.

Complete mitochondrial genome of Ciconia nigra (Ciconiiformes: Ciconiidae), a threatened stork in China.
复制标题

中国濒危鹳鹳(鹳形目:鹳科)完整线粒体基因组

DOI:
10.1080/23802359.2019.1640082
复制
发表时间:
2019-07-13
期刊:
Mitochondrial DNA. Part B, Resources
影响因子:
--
通讯作者:
Ren ZM
Ren ZM
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
Liang WL;Zhu J;Ren ZM

文献摘要

参考文献

被引文献

相似文献

采用鸟枪法对华北黑鹳线粒体全基因组(mitogenome)进行测序。 C. nigra 的线粒体基因组长度为 17,787bp,由 13 个蛋白质编码基因、22 个 tRNA、2 个 rRNA 和 1 个非编码控制区(D 环)组成。所有蛋白质编码基因均以 ATG 密码子起始,ND2、ND3 和 COX1 除外,它们分别使用 ATA、ATC 和 GTG 作为起始密码子。蛋白质编码基因的终止密码子表现出丰富的多样性,有六种终止密码子(TAA、AGG、AGA、TAG、T和A)。基于13个蛋白质编码基因的系统发育树表明,白鹳形成了一个单系类群,与Threskiorothidae物种聚类的进化枝是姊妹类。
The complete mitochondrial genome (mitogenome) of black stork Ciconia nigra from North China was sequenced by shotgun genome-skimming method. The mitogenome of C. nigra was 17,787 bp in length and consists of 13 protein-coding genes, 22 tRNAs, two rRNAs, and one non-coding control region (D-loop). All protein-coding genes initiate with ATG codon except for ND2, ND3, and COX1, which uses ATA, ATC, and GTG as their initiation codons, respectively. The termination codon of protein-coding genes shows rich diversity with six termination codons (TAA, AGG, AGA, TAG, T, and A). The phylogenetic trees based on 13 protein-coding genes showed that Ciconia formed a monophyletic group, which was sister to the clade clustered by Threskiorothidae species.
DOI: 10.1080/23802359.2017.1310608
发表时间: 2017-04-24
期刊: Mitochondrial DNA. Part B, Resources
影响因子: --
作者:
Lee MY;Jeon HS;Kim YJ;An J
通讯作者: An J
DOI: 10.1007/s10336-010-0536-6
发表时间: 2011-01-01
影响因子: 1.3
作者:
Chevallier, D.;Le Maho, Y.;Massemin, S.
通讯作者: Massemin, S.
DOI: 10.3109/19401736.2014.883616
发表时间: 2016-01-02
影响因子: --
作者:
Liu, Mengyao;Kang, Chunlan;Zeng, Tao
通讯作者: Zeng, Tao
DOI: 10.1007/s10336-014-1135-8
发表时间: 2015-04-01
影响因子: 1.3
作者:
Konovalov, Annika;Kaldma, Katrin;Vaeli, Uelo
通讯作者: Vaeli, Uelo