A regulatory variation in OPRK1, the gene encoding the kappa-opioid receptor, is associated with alcohol dependence.
A regulatory variation in OPRK1, the gene encoding the kappa-opioid receptor, is associated with alcohol dependence.
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DOI：
10.1093/hmg/ddn068
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发表时间：
2008-06-15
影响因子：
3.5
通讯作者：
Foroud T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Edenberg HJ;Wang J;Tian H;Pochareddy S;Xuei X;Wetherill L;Goate A;Hinrichs T;Kuperman S;Nurnberger JI Jr;Schuckit M;Tischfield JA;Foroud T
编码κ-阿片受体的OPRK 1的变异与酒精依赖的风险相关。对具有较高和较低风险单倍型的DNA进行测序，揭示了位于翻译起始位点上游1986 bp（转录起始位点上游1389 bp）处的插入/缺失（indel），其具有830 bp的净添加。我们证明了从-1647到-10 bp或从-2312到-10 bp（相对于翻译起始位点）的上游区域可以在瞬时转染试验中起启动子的作用。然后我们确定indel的存在使转录活性降低了一半。我们使用PCR检测基因型个体在219个多重酒精依赖的欧洲裔美国人后裔的存在或不存在这个indel的家庭。以家族为基础的关联分析发现了这种插入与酒精中毒相关的重要证据;较长的等位基因（具有插入缺失），表达较低，与酒精中毒的风险较高相关。因此，这种插入缺失是一种功能性调节变异，可能至少部分解释OPRK 1与酒精依赖的关联。
Variations in OPRK1, which encodes the κ-opioid receptor, are associated with the risk for alcohol dependence. Sequencing DNAs with higher and lower risk haplotypes revealed an insertion/deletion (indel) with a net addition of 830 bp located 1986 bp upstream of the translation start site (1389 bp upstream of the transcription start site). We demonstrated that the upstream region extending from −1647 to −10 bp or from −2312 to −10 bp (relative to the translation start site) could function as a promoter in transient transfection assays. We then determined that the presence of the indel reduced transcriptional activity by half. We used a PCR assay to genotype individuals in 219 multiplex alcohol-dependent families of European American descent for the presence or absence of this indel. Family-based association analyses detected significant evidence of association of this insertion with alcoholism; the longer allele (with the indel), which had lower expression, is associated with higher risk for alcoholism. This indel is, therefore, a functional regulatory variation likely to explain at least part of the association of OPRK1 with alcohol dependence.
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DOI：
10.1002/ajmg.b.30510
发表时间：
2007-09-05
影响因子：
2.8
作者：
Gerra, G.;Leonardi, C.;Donnini, C.
通讯作者：
Donnini, C.
影响因子：
3.4
作者：
Hölter, SM;Henniger, MSH;Spanagel, R
通讯作者：
Spanagel, R
影响因子：
2.3
作者：
Lindholm, S;Ploj, K;Nylander, I
通讯作者：
Nylander, I
DOI：
10.1073/pnas.89.6.2046
发表时间：
1992-03-15
影响因子：
11.1
作者：
SPANAGEL, R;HERZ, A;SHIPPENBERG, TS
通讯作者：
SHIPPENBERG, TS
影响因子：
2.1
作者：
Dudbridge, F
通讯作者：
Dudbridge, F