Distinct genetic architectures for phenotype means and plasticities in Zea mays.
Distinct genetic architectures for phenotype means and plasticities in Zea mays.
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DOI：
10.1038/s41477-017-0007-7
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发表时间：
2017-09
期刊：
影响因子：
18
通讯作者：
Schnable PS
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kusmec A;Srinivasan S;Nettleton D;Schnable PS
表型可塑性描述了当基因型暴露于不同环境时性状的表型变异。了解玉米等作物表型可塑性的遗传控制对于在经历气候变化的世界中保持和增加产量至关重要。在这里，我们报告了玉米巢式关联作图（US-NAM）群体在多种环境中生长的多个表型和两个表型可塑性指标的全基因组关联分析的结果，这些群体的基因型具有约250万个单核苷酸多态性（SNP）。我们发现，在所有性状的候选基因的平均表型值和可塑性措施形成结构和功能不同的群体。这种独立的遗传控制表明，育种者将能够半独立地选择平均表型值和可塑性，从而产生具有高平均表型值和可塑性水平的品种，这些都适合于目标性能环境。
Phenotypic plasticity describes the phenotypic variation of a trait when a genotype is exposed to different environments. Understanding the genetic control of phenotypic plasticity in crops such as maize is of paramount importance for maintaining and increasing yields in a world experiencing climate change. Here, we report the results of genome-wide association analyses of multiple phenotypes and two measures of phenotypic plasticity in the maize nested association mapping (US-NAM) population grown in multiple environments and genotyped with ~2.5 million single nucleotide polymorphisms (SNPs). We show that across all traits the candidate genes for mean phenotype values and plasticity measures form structurally and functionally distinct groups. Such independent genetic control suggests that breeders will be able to select semi-independently for mean phenotype values and plasticity, thereby generating varieties with both high mean phenotype values and levels of plasticity that are appropriate for the target performance environments.
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