Direct detection of abortive RNA transcripts in vivo.

Direct detection of abortive RNA transcripts in vivo.
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DOI:
10.1126/science.1169237
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发表时间:
2009-05-15
期刊:
Science (New York, N.Y.)
影响因子:
--
通讯作者:
Nickels BE
Nickels BE
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
Goldman SR;Ebright RH;Nickels BE

文献摘要

参考文献

被引文献

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在体外转录起始过程中,RNA聚合酶可以参与失败的起始-在生产性起始之前合成和释放短的2至15个核苷酸的RNA转录物。目前还不知道是否流产启动发生在体内。使用杂交与锁核酸探针,我们直接检测流产的成绩单在体内,从而表明,流产的启动发生在体内。我们进一步表明,在体内的流产启动是一个决定因素的启动子强度,RNA聚合酶功能的决定因素,并通过转录因子GreA调节的目标。流产转录本可能在调节体内基因表达方面具有功能性、生理学上的重要作用。
During transcription initiation in vitro, RNA polymerase can engage in abortive initiation–the synthesis and release of short, 2 to 15 nucleotide, RNA transcripts–prior to productive initiation. It has not been known whether abortive initiation occurs in vivo. Using hybridization with locked nucleic acid probes, we directly detect abortive transcripts in vivo and thereby show that abortive initiation occurs in vivo. We further show that abortive initiation in vivo is a determinant of promoter strength, a determinant of RNA polymerase function, and a target of regulation by transcription factor GreA. Abortive transcripts may have functional, physiologically important roles in regulating gene expression in vivo.
DOI: 10.1093/nar/gnh171
发表时间: 2004-01-01
影响因子: 14.9
作者:
Válóczi, A;Hornyik, C;Havelda, Z
通讯作者: Havelda, Z
DOI: 10.1021/bi026962v
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作者:
Vo, NV;Hsu, LM;Chamberlin, MJ
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DOI: 10.1038/sj.emboj.7601612
发表时间: 2007-03-21
期刊: EMBO JOURNAL
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作者:
Leibman, Mark;Hochschild, Ann
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发表时间: 1995-12-05
影响因子: 11.1
作者:
HSU, LM;VO, NV;CHAMBERLIN, MJ
通讯作者: CHAMBERLIN, MJ
DOI: 10.1002/j.1460-2075.1986.tb04597.x
发表时间: 1986-11-01
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影响因子: 11.4
作者:
KAMMERER, W;DEUSCHLE, U;BUJARD, H
通讯作者: BUJARD, H