Mechanistic insight into how multidrug resistant Acinetobacter baumannii response regulator AdeR recognizes an intercistronic region.
Mechanistic insight into how multidrug resistant Acinetobacter baumannii response regulator AdeR recognizes an intercistronic region.
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多药耐药鲍曼不动杆菌反应调节因子 AdeR 如何识别顺反子间区域的机制洞察
DOI：
10.1093/nar/gkx624
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发表时间：
2017-09-19
影响因子：
14.9
通讯作者：
Zheng F
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wen Y;Ouyang Z;Yu Y;Zhou X;Pei Y;Devreese B;Higgins PG;Zheng F
AdeR-AdeS是一个双组分调节系统，其控制参与鲍曼不动杆菌多药耐药的adeABC外排泵的表达。AdeR是一种应答调节因子，由N端受体结构域和C端DNA结合结构域组成。AdeR与AdeR和AdeABC之间的顺反子间区域中的直接重复DNA结合。我们证明了非磷酸化的AdeR和DNA之间具有显着高的亲和力结合，解离常数为20 nM。此外，我们提供了一个2.75 μ m的晶体结构的AdeR DNA结合域与顺反子间的DNA复合物。这种结构表明，由β5-β6形成的α3和β发夹与DNA的大沟和小沟相互作用，从而导致引入弯曲。AdeR受体结构域结构揭示了由齿轮样结构介导的二聚化基序，该齿轮样结构涉及D108 F109-R122基序通过阳离子π堆叠相互作用。AdeR受体结构域与镁离子结合的结构表明存在一个保守的Glu 19 Asp 20-Asp 63镁离子结合基序，并揭示了潜在的磷酸化位点Asp 63 OD 1与Lys 112形成氢键。因此，我们剖析了AdeR如何识别顺反子间DNA的机制，这导致了不同的反应调节模式。解锁AdeRS机制提供了规避A的方法。鲍曼不动杆菌耐药性
AdeR–AdeS is a two-component regulatory system, which controls expression of the adeABC efflux pump involved in Acinetobacter baumannii multidrug resistance. AdeR is a response regulator consisting of an N-terminal receiver domain and a C-terminal DNA-binding-domain. AdeR binds to a direct-repeat DNA in the intercistronic region between adeR and adeABC. We demonstrate a markedly high affinity binding between unphosphorylated AdeR and DNA with a dissociation constant of 20 nM. In addition, we provide a 2.75 Å crystal structure of AdeR DNA-binding-domain complexed with the intercistronic DNA. This structure shows that the α3 and β hairpin formed by β5–β6 interacts with the major and minor groove of the DNA, which in turn leads to the introduction of a bend. The AdeR receiver domain structure revealed a dimerization motif mediated by a gearwheel-like structure involving the D108F109-R122 motif through cation π stack interaction. The structure of AdeR receiver domain bound with magnesium indicated a conserved Glu19Asp20-Asp63 magnesium-binding motif, and revealed that the potential phosphorylation site Asp63OD1 forms a hydrogen bond with Lys112. We thus dissected the mechanism of how AdeR recognizes the intercistronic DNA, which leads to a diverse mode of response regulation. Unlocking the AdeRS mechanism provides ways to circumvent A. baumannii antibiotic resistance.
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影响因子：
3.5
作者：
Kröger C;Kary SC;Schauer K;Cameron AD
通讯作者：
Cameron AD
DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
DOI：
10.1107/s0907444909052925
发表时间：
2010-02
期刊：
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography
影响因子：
--
作者：
Adams PD;Afonine PV;Bunkóczi G;Chen VB;Davis IW;Echols N;Headd JJ;Hung LW;Kapral GJ;Grosse-Kunstleve RW;McCoy AJ;Moriarty NW;Oeffner R;Read RJ;Richardson DC;Richardson JS;Terwilliger TC;Zwart PH
通讯作者：
Zwart PH
双组分反应调节器 RstA 识别启动子 DNA 元件的结构动力学。
影响因子：
14.9
作者：
Li YC;Chang CK;Chang CF;Cheng YH;Fang PJ;Yu T;Chen SC;Li YC;Hsiao CD;Huang TH
通讯作者：
Huang TH
影响因子：
5.4
作者：
Bourret, Robert B.
通讯作者：
Bourret, Robert B.