Influence of combinatorial histone modifications on antibody and effector protein recognition.
Influence of combinatorial histone modifications on antibody and effector protein recognition.
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DOI：
10.1016/j.cub.2010.11.058
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发表时间：
2011-01-11
期刊：
影响因子：
9.2
通讯作者：
Strahl, Brian D.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fuchs, Stephen M.;Krajewski, Krzysztof;Baker, Richard W.;Miller, Victoria L.;Strahl, Brian D.
我们报告了一个通用的方法来检查识别的翻译后修饰（PTM）的抗体和蛋白质。我们使用这种方法来评估修饰特异性抗体和染色质相关因子与一系列高纯度的生物素化肽（来源于人组蛋白序列）的结合，这些肽含有打印在链霉亲和素包被的载玻片上的多个PTM。我们发现修饰特异性抗体在PTM识别方面比预期的更混杂，并且受到邻近PTM的高度影响。染色质相关因子的结合也受到组合PTM的影响，进一步支持了“组蛋白密码”假说。因此，我们报告了PTM对抗体识别的影响的第一个彻底的表征，并描述了一种用于快速和廉价评估染色质相关因子结合特异性的工具。
We report a general method to examine the recognition of post-translational modifications (PTMs) by antibodies and proteins. We use this method to evaluate the binding of modification-specific antibodies and chromatin-associating factors to an array of high-purified, biotinylated peptides (derived from human histone sequences) harboring multiple PTMs printed onto streptavidin-coated glass slides. We find that modification-specific antibodies are both more promiscuous in their PTM recognition than expected and highly influenced by neighboring PTMs. Binding of chromatin-associating factors is also influenced by combinatorial PTMs, giving further support for the “Histone Code” hypothesis. Thus we report the first thorough characterization of PTM influence on antibody recognition and describe a tool for the rapid and inexpensive assessment of chromatin-associating factor binding specificity.
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DOI：
10.1016/j.bbagrm.2008.07.008
发表时间：
2009-01
影响因子：
4.7
作者：
Fuchs, Stephen M.;Laribee, R. Nicholas;Strahl, Brian D.
通讯作者：
Strahl, Brian D.
DOI：
10.1073/pnas.0709170104
发表时间：
2007-11-27
影响因子：
11.1
作者：
Ramon-Maiques, Santiago;Kuo, Alex J.;Yang, Wei
通讯作者：
Yang, Wei
影响因子：
4.4
作者：
Liu, Huadong;Galka, Marek;Li, Shawn S. C.
通讯作者：
Li, Shawn S. C.
染色质结合模块的组合分析揭示了多位点歧视。
影响因子：
14.8
作者：
Garske, Adam L.;Oliver, Samuel S.;Wagner, Elise K.;Musselman, Catherine A.;LeRoy, Gary;Garcia, Benjamin A.;Kutateladze, Tatiana G.;Denu, John M.
通讯作者：
Denu, John M.
影响因子：
3.7
作者：
Bock, Ina;Dhayalan, Arunkumar;Jeltsch, Albert
通讯作者：
Jeltsch, Albert