Heterologous stop codon readthrough of metazoan readthrough candidates in yeast.
Heterologous stop codon readthrough of metazoan readthrough candidates in yeast.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0059450
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发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Kellis M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chan CS;Jungreis I;Kellis M
对哺乳动物、果蝇和线虫的基因组特征的近期分析表明，功能性翻译终止密码子通读在后生动物中比之前所认识到的要普遍得多，但该分析对通读的功能或机制仅提供了有限的线索。如果一种已知在一个物种中发生通读的信使核糖核酸（mRNA）在另一个物种中也发生通读，也许这些问题可以在一个更简单的环境中进行研究。出于这个目的，我们研究了人类、果蝇和线虫中的一些通读基因在酿酒酵母中表达时是否也表现出通读。我们发现，在一个具有已知能触发通读的终止密码子后六聚体的基因中通读率最高，而其他后生动物的通读基因在酿酒酵母中表现出临界通读。
Recent analysis of genomic signatures in mammals, flies, and worms indicates that functional translational stop codon readthrough is considerably more abundant in metazoa than previously recognized, but this analysis provides only limited clues about the function or mechanism of readthrough. If an mRNA known to be read through in one species is also read through in another, perhaps these questions can be studied in a simpler setting. With this end in mind, we have investigated whether some of the readthrough genes in human, fly, and worm also exhibit readthrough when expressed in S. cerevisiae. We found that readthrough was highest in a gene with a post-stop hexamer known to trigger readthrough, while other metazoan readthrough genes exhibit borderline readthrough in S. cerevisiae.
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影响因子：
14.9
作者：
Namy O;Duchateau-Nguyen G;Hatin I;Hermann-Le Denmat S;Termier M;Rousset JP
通讯作者：
Rousset JP
DOI：
10.1093/bioinformatics/btr209
发表时间：
2011-07-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Lin MF;Jungreis I;Kellis M
通讯作者：
Kellis M
影响因子：
5.6
作者：
Salas-Marco, J;Bedwell, DM
通讯作者：
Bedwell, DM
影响因子：
7
作者：
Jungreis, Irwin;Lin, Michael F.;Kellis, Manolis
通讯作者：
Kellis, Manolis
影响因子：
--
作者：
McNabb, DS;Reed, R;Marciniak, RA
通讯作者：
Marciniak, RA