Kinetic cell-based morphological screening: prediction of mechanism of compound action and off-target effects.
Kinetic cell-based morphological screening: prediction of mechanism of compound action and off-target effects.
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DOI：
10.1016/j.chembiol.2009.05.011
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发表时间：
2009-07-31
影响因子：
--
通讯作者：
Xu X
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Abassi YA;Xi B;Zhang W;Ye P;Kirstein SL;Gaylord MR;Feinstein SC;Wang X;Xu X
我们描述了一种基于细胞的动力学分析方法，使用阻抗读数来监测小分子化合物的影响。这种非侵入性读数允许连续采样细胞对生物活性化合物的反应，随后的动力学分布提供了关于化合物与细胞的时间相互作用的信息。通过筛选包含FDA批准的药物、实验化合物和天然化合物的文库，测试了该方法的实用性。活性相似的化合物产生类似的基于阻抗的时间依赖细胞响应曲线(TCRP)。根据TCRP相似度对化合物进行了聚类。我们确定了现有药物的新机制，证实了之前报道的环氧合酶-2抑制剂塞来昔布的钙调节活性，并确定了实验化合物孟纳曲醇的另一种机制。我们还鉴定并鉴定了一种新的抗有丝分裂药物。我们的发现表明，TCRP方法为小分子化合物提供了预测机理信息。
We describe a cell-based kinetic profiling approach using impedance readout for monitoring the effect of small molecule compounds. This non-invasive readout allows continuous sampling of cellular responses to biologically active compounds and the ensuing kinetic profile provides information regarding the temporal interaction of compounds with cells. The utility of this approach was tested by screening a library containing FDA approved drugs, experimental compounds and nature compounds. Compounds with similar activity produced similar impedance-based time-dependent cell response profiles (TCRP). The compounds were clustered based on TCRP similarity. We identified novel mechanisms for existing drugs, confirmed previously reported calcium modulating activity for COX-2 inhibitor, celecoxib and identified an additional mechanism for the experimental compound, monastrol. We also identified and characterized a new anti-mitotic agent. Our findings indicate TCRP approach provides predictive mechanistic information for small molecule compounds.
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DOI：
10.1016/0006-291x(84)91062-3
发表时间：
1984-01-01
影响因子：
3.1
作者：
LAM, HYP
通讯作者：
LAM, HYP
影响因子：
5.1
作者：
López-Ládzaro, M;Pastor, N;Cortés, F
通讯作者：
Cortés, F
影响因子：
46.9
作者：
Leung, D;Hardouin, C;Cravatt, BF
通讯作者：
Cravatt, BF
影响因子：
50.3
作者：
Hieronymus, Haley;Lamb, Justin;Golub, Todd R.
通讯作者：
Golub, Todd R.
影响因子：
4.7
作者：
AIZUYOKOTA, E;ICHINOSEKI, K;SATO, Y
通讯作者：
SATO, Y