AtlasXplore: a web platform for visualizing and sharing spatial epigenome data.
AtlasXplore: a web platform for visualizing and sharing spatial epigenome data.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btad447
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发表时间：
2023-08-01
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文献类型：
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近年来，越来越多的空间表观基因组数据集被生成，为研究实体组织切片的调控机制提供了丰富的机会。然而，这些数据集的可视化探索需要对原始数据进行大量的计算处理，这对没有高级计算技能的研究人员来说是一个挑战，无法充分探索和分析这些数据集。在这里，我们介绍AtlasXplore，这是一个基于网络的平台，使科学家能够使用扩展的工具集交互式地浏览不断增长的空间表观基因组数据集。https://web.atlasxomics.com
In recent years, a growing number of spatial epigenome datasets have been generated, presenting rich opportunities for studying the regulation mechanisms in solid tissue sections. However, visual exploration of these datasets requires extensive computational processing of raw data, presenting a challenge for researchers without advanced computational skills to fully explore and analyze such datasets. Here, we introduce AtlasXplore, a web-based platform that enables scientists to interactively navigate a growing collection of spatial epigenome data using an expanding set of tools. https://web.atlasxomics.com
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影响因子：
64.8
作者：
Cao, Junyue;Spielmann, Malte;Shendure, Jay
通讯作者：
Shendure, Jay
影响因子：
64.8
作者：
Deng, Yanxiang;Bartosovic, Marek;Ma, Sai;Zhang, Di;Kukanja, Petra;Xiao, Yang;Su, Graham;Liu, Yang;Qin, Xiaoyu;Rosoklija, Gorazd B.;Dwork, Andrew J.;Mann, J. John;Xu, Mina L.;Halene, Stephanie;Craft, Joseph E.;Leong, Kam W.;Boldrini, Maura;Castelo-Branco, Goncalo;Fan, Rong
通讯作者：
Fan, Rong
影响因子：
48
作者：
Aibar, Sara;Gonzalez-Blas, Carmen Bravo;Aerts, Stein
通讯作者：
Aerts, Stein
影响因子：
64.8
作者：
Zhang, Di;Deng, Yanxiang;Kukanja, Petra;Agirre, Eneritz;Bartosovic, Marek;Dong, Mingze;Ma, Cong;Ma, Sai;Su, Graham;Bao, Shuozhen;Liu, Yang;Xiao, Yang;Rosoklija, Gorazd B.;Dwork, Andrew J.;Mann, J. John;Leong, Kam W.;Boldrini, Maura;Wang, Liya;Haeussler, Maximilian;Raphael, Benjamin J.;Kluger, Yuval;Castelo-Branco, Goncalo;Fan, Rong
通讯作者：
Fan, Rong
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2.3
作者：
Li, Haoming;Jin, Guohua;Zou, Linqing
通讯作者：
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