The relation of the X-ray B-factor to protein dynamics: insights from recent dynamic solid-state NMR data
The relation of the X-ray B-factor to protein dynamics: insights from recent dynamic solid-state NMR data
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X 射线 B 因子与蛋白质动力学的关系：来自最新动态固态 NMR 数据的见解
DOI：
10.1080/07391102.2012.689695
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发表时间：
2012
影响因子：
4.4
通讯作者：
Krushelnitsky
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Reichert;Zinkevich;Saalwachter;Krushelnitsky
为了解决从蛋白质的x射线散射数据中获得的b因子在理解蛋白质（功能）动力学方面的潜在用途，我们将五种不同蛋白质（SH3结构域、Crh、GB1、泛素和硫氧还蛋白）的b因子与最近的固态核磁共振实验数据进行了比较，这些实验数据反映了在明确定义的时间尺度上的真实（旋转）动力学。除了涉及移动环区和链末端的微不足道的相关性外，我们发现b因子与任何所研究的时间尺度上的动态数据没有显著的相关性，结论是b因子与蛋白质内部重定向动力学没有独特的和一般的相关性。
In addressing the potential use of B-factors derived from X-ray scattering data of proteins for the understanding the (functional) dynamics of proteins, we present a comparison of B-factors of five different proteins (SH3 domain, Crh, GB1, ubiquitin and thioredoxin) with data from recent solid-state nuclear magnetic resonance experiments reflecting true (rotational) dynamics on well-defined timescales. Apart from trivial correlations involving mobile loop regions and chain termini, we find no significant correlation of B-factors with the dynamic data on any of the investigated timescales, concluding that there is no unique and general correlation of B-factors with the internal reorientational dynamics of proteins.
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影响因子：
15
作者：
Lewandowski, Jozef R.;Sein, Julien;Emsley, Lyndon
通讯作者：
Emsley, Lyndon
DOI：
10.1073/pnas.88.7.2773
发表时间：
1991-04-01
影响因子：
11.1
作者：
KURIYAN, J;WEIS, WI
通讯作者：
WEIS, WI
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DOI：
10.1002/pro.335
发表时间：
2010
期刊：
Protein science : a publication of the Protein Society
影响因子：
--
作者：
Jensen,DavinR;Woytovich,Christopher;Li,Margie;Duvnjak,Petar;Cassidy,MichaelS;Frederick,RonnieO;Bergeman,LaiF;Peterson,FrancisC;Volkman,BrianF
通讯作者：
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影响因子：
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作者：
Charpentier TH;Thompson LE;Liriano MA;Varney KM;Wilder PT;Pozharski E;Toth EA;Weber DJ
通讯作者：
Weber DJ
影响因子：
15
作者：
Giraud, N;Böckmann, A;Emsley, L
通讯作者：
Emsley, L